怎样从芬兰数据库下载的数据中提取VCF文件
函数‘readVcf’标签‘"data.table", "missing"’找不到继承方法。
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求救各位大佬,用之前在网上copy的代码解读vcf文件时出现了问题,原代码是用在GWAS 上下载的数据,数据格式直接就是vcf文件,但是芬兰数据库下载的文件没有后缀名,用VariantAnnotation包的readvcf函数读根本就读不出来,代码:
library(VariantAnnotation)
outcomeFile <- fread(input="finngen_R9_G6_MYASTHENIA.gz",sep="\t",header=T)
vcfRT <- readVcf(outcomeFile)
报错内容:
函数‘readVcf’标签‘"data.table", "missing"’找不到继承方法
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