【地平线开发板 模型转换】将pytorch生成的onnx模型转换成.bin模型
文章目录1 获取onnx模型2 启动docker容器3 onnx模型检查3.1 为什么要检查?3.2 如何操作4 图像数据预处理4.1 一些问题的思考4.2 图片挑选与放置4.2 使用地平线提供的模板进行图像预处理4.3 使用自己写的图像预处理函数4.4 归一化前后 图像数据 均值与方差怎么变 ?5 获取.bin模型5.1 03_build.sh5.2 resnet34_config.yaml6
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1 获取onnx模型
我是使用pytorch训练得到的pth模型
,转成onnx模型,这一步之前写过博客,可参考:pytorch分类模型导出onnx模型并验证
2 启动docker容器
如果之前在开发机上已经安装过地平线给的docker开发环境,可直接执行指令:
docker start horizon # 启动horizon,horizon是我的容器container 别名
docker attach horizon # 进入horizon
如果你之前没安装过,也没学过docker的相关知识,可参考我的另一篇博客:配置地平线提供的docker开发环境。
3 onnx模型检查
3.1 为什么要检查?
官方回答: 验证模型中所使用的算子需要符合地平线平台的算子约束。
翻译回答: onnx模型中,不是所有的函数“我”都支持,你得用“我”支持的。怎么知道“我”是否支持呢?给你个excel表让你查太费事,写个函数让程序查吧,这样快!
3.2 如何操作
把在第一步得到的mobilenetv2.onnx
模型,放到开发机的指定位置:
/data/wyx/horizon/horizon_xj3_open_explorer_v1.8.5_20211224/ddk/samples/ai_toolchain/horizon_model_convert_sample/03_classification/05_efficientnet_lite0_onnx/mobilenetv2_x3/output/
没有哪个文件夹,就新建它,如下图所示:
为什么要这样放?回答:有些地方方便使用地平线提供的文件,往下看,你会明白的。
然后在mobilenetv2_x3
文件夹下,新建一个01_check.sh
文件,内容如下:
#!/usr/bin/env sh
set -e -v
cd $(dirname $0) || exit
# 模型类型,本文以onnx为例
model_type="onnx"
# 要检查的onnx模型位置
onnx_model="./output/mobilenetv2.onnx"
# 检查输出日志,放到哪里去
# 虽然它还是放到了与01_check.sh同级目录下(感觉像小bug)
output="./model_output/mobilenetv2_checker.log"
# 用的什么架构,不用改
march="bernoulli2"
hb_mapper checker --model-type ${model_type} \
--model ${onnx_model} \
--output ${output} --march ${march}
解释一下:hb_mapper checker
就是地平线专属命令了,俗称“工具”。
cd到mobilenetv2_x3
文件夹下,执行命令:
sh 01_check.sh
输出比较重要的部分如下,第二列是BPU,说明算子运行在BPU上,同理,也可能运行在CPU上。
多数算子bpu都支持,包括卷积conv、池化pool、全连接fc等操作。
对于不支持的算子,算了,我们就先让它在CPU上跑。
4 图像数据预处理
本来以为模型检查完,一行命令加载onnx模型,一行命令输出能在地平线开发板上运行的模型。
总体看,确实是,但是,呵,天真。
4.1 一些问题的思考
- 问题1: 模型转换是什么?
回答: 模型转换,是指模型经过量化(例如,网络参数从float32转换成int8)、算子重组、结构优化等一系列操作,得到新的模型,这个新的模型体积更小,推理速度更快。 - 问题2: 为什么要进行模型转换?
回答: 服务器端训练得到的模型,想跑到各家开发板上,就得适应各家开发板的架构,学底层太费事,故用一套工具链,帮助你快速把服务器端的模型转换得到能在开发板上跑的模型。 - 问题3: 为什么要进行图像数据预处理?
回答: 地平线的量化方案属于“数据依赖型”,也就是说,在进行模型量化时,需要有 典型图片 输入作为支撑。 - 问题4: 什么样的图片能称为典型呢?
回答: 比如分类数据集,每一类都挑到,随机挑就好。一共挑50~100张即可。
4.2 图片挑选与放置
从5个类别中,每个类别随机挑了20张图片,放在mobilenetv2_x3/data/image_origin/
文件夹下,同时新建一个文件夹image_converted_rgb_f32
,用于存放处理后的图像,如图所示:
下面就是对挑选的图片进行处理了。这里我提供两种方法,一种是根据地平线提供的模板进行图像预处理,但它跳来跳去的,而且包括的内容太多,我自己又写了一个flower_data_preprocess.py
,实现同样的功能,下面分别介绍。
4.2 使用地平线提供的模板进行图像预处理
如下图所示,在mobilenetv2_x3
文件夹下需要有这三个文件,下面分别介绍其作用及内容:
02_preprocess.sh
内容如下:
#!/usr/bin/env bash
set -e -v
cd $(dirname $0) || exit
python3 ../../../data_preprocess.py \
--src_dir ./data/image_origin \
--dst_dir ./data/image_converted_rgb_f32 \
--pic_ext .rgb \
--read_mode opencv
src_dir: 原图片路径
des_dir: 处理后图片存哪
pic_ext: 处理后图片后缀名
read_mode: 读取图片的方式,有opencv和skimage两种
很明显告诉我们运行那个文件,往里传哪些参数,注意此时data_preprocess.py
的路径,这是文件默认的路径。
至于data_preprocess.py
里面的内容就不再介绍了,不然跳来跳去,讲不完了。反正data_preprocess.py
是地平线给的,用就完事了。
preprocess.py
data_preprocess.py
中会用到preprocess.py
文件中的一个函数,如果没有这个文件,会报错,如下图所示。至于里面的内容,就不展开了,不然又得跳了。
data
文件夹
里面放着挑选出来的图片,处理后的图片也会放在这里面。
在mobilenetv2_x3
文件夹下,执行命令:
sh 02_preprocess.sh
运行界面及结果如下图所示:
4.3 使用自己写的图像预处理函数
自己写的图像预处理函数放在flower_data_preprocess.py
文件中,文件放在resnet_x3
文件夹下,实现效果与4.2节一致,其内容如下:
对于关注的归一化操作,预训练权重的均值与方差怎么办问题,详看代码注释。
import cv2
import os
import numpy as np
## ------------------------------------------------------------#
# src_dir:原始jpg图片
# dst_dir:处理后的图片存放的路径
# pic_ext:处理后的图片后缀名(影响不大,只是为了说明它的通道顺序)
## ------------------------------------------------------------#
src_dir = './origin_image'
dst_dir = './image_converted_rgb_f32' # yaml文件中cal_data_dir参数配置成这个路径即可
pic_ext = '.rgb'
if not os.path.exists(dst_dir):
os.mkdir(dst_dir)
## ---------------------------------------#
# 一次只操作一张图片
## ---------------------------------------#
for src_name in sorted(os.listdir(src_dir)):
## -----------------------------#
# 把图片路径拼出来
## -----------------------------#
src_file = os.path.join(src_dir, src_name)
## -----------------------------#
## opencv实现预处理
## -----------------------------#
img = cv2.imread(src_file)
img = cv2.resize(np.array(img), (224, 224), interpolation=cv2.INTER_CUBIC).astype(np.float32)
## -----------------------------------------------------#
# PC端网络训练时,数据需要归一化,为何在这儿不做?
# 答:模型转换时,需要的图像输入分为是0~255,归一化操作会集成
# 在yaml文件中mean和scale中,故不要归一化。
## -----------------------------------------------------#
# img /= 255.0
# ---------------------------------------#
# 常规操作是:先转成RGB,再减均值,除方差
# 到底要不要转成rgb,主要看,模型训练时用的是啥,
# 毕竟在后面yaml配置中,这两个参数都行
# ---------------------------------------#
img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2RGB)
## -----------------------------------------------------------------------------------------#
# PC端网络训练时,数据需要减均值,除方差,为何在这儿不做?
# 答:为了和yaml中data_mean_and_scale下的mean_value与scale_value参数配合
# 在yaml文件中设置即可
## -----------------------------------------------------------------------------------------#
# img -= [0.485, 0.456, 0.406]
# img /= [0.229, 0.224, 0.225]
## ------------------------------------------------------------------#
# 从HWC,变为CHW。用的是Pytorch框架,其输入是NCHW,故需要这一步。
## ------------------------------------------------------------------#
img = img.transpose(2, 0, 1)
# ---------------------------------------#
# 添加batch维度,实际运用时,有没有这一行都行
# 至此,图像预处理完毕
# ---------------------------------------#
# img = np.expand_dims(img, 0)
# img = img[np.newaxis,:,:,:]
# -----------------------------------------------------#
# os.path.basename:返回最后的 文件名
# 例如:os.path.basename("./src/1.jpg"),返回:1.jpg
# -----------------------------------------------------#
filename = os.path.basename(src_file)
# print(src_file)
# -----------------------------------------------------#
# os.path.splitext: 把图片名和图片扩展名分开,
# 例如:1.jpg,short_name=1, ext=.jpg
# -----------------------------------------------------#
short_name, ext = os.path.splitext(filename)
# ---------------------------------------#
# 新的图片名
# ---------------------------------------#
pic_name = os.path.join(dst_dir, short_name + pic_ext)
dtype = np.float32
img.astype(dtype).tofile(pic_name)
print("write:%s" % pic_name)
运行效果如下图所示:
4.4 归一化前后 图像数据 均值与方差怎么变 ?
对于在服务器端使用Pytorch训练网络是,通常会归一化图像数据,然后减去均值,除以方差,再传入网络。
在训练网络模型时,我们大多会使用Imagenet数据集或者COCO数据集的预训练权重,用它们的均值和方差,例如:
if 'coco' in args.dataset:
mean_vals = [0.471, 0.448, 0.408]
std_vals = [0.234, 0.239, 0.242]
elif 'imagenet' in args.dataset:
mean_vals = [0.485, 0.456, 0.406]
std_vals = [0.229, 0.224, 0.225]
这些都是归一化后的均值与方差。那归一化前后数据的均值与方差又有着怎么的关系呢?用个例子说明:
import numpy as np
a = np.array([4,8,12,16])
b = a / 255.0
mean_a = np.mean(a)
mean_b = np.mean(b)
std_a = np.std(a)
std_b = np.std(b)
print("mean_a", mean_a)
print("mean_b", mean_b)
print("std_a", std_a)
print("std_b", std_b)
运行输出:
PS D:\DeepLearning\classification> python .\1.py
mean_a 10.0
mean_b 0.0392156862745098
std_a 4.47213595499958
std_b 0.01753778805882188
可以发现mean_b = mean_a / 255
,std_b = std_a / 255
,也就是说对于归一化后的数据其均值与方差均是归一化前的数据的
1
255
\frac{1}{255}
2551。
5 获取.bin模型
准备好处理后的图像数据,下面就是获取能够在开发板上运行的模型了,地平线在开发板上运行的模型后缀为.bin
,故在此称为.bin
模型。
这一步需要准备两个文件,一个是03_build.sh
,一个是mobilenetv2_config.yaml
,两个文件均放于mobilenetv2_x3
文件夹下。下面分别介绍这两个文件里的内容:
5.1 03_build.sh
加载mobilenetv2_config.yaml
文件,使用hb_mapper中的makertbin工具去操作即可。
#!/bin/bash
set -e -v
cd $(dirname $0)
config_file="./mobilenetv2_config.yaml"
model_type="onnx"
# build model
hb_mapper makertbin --config ${config_file} \
--model-type ${model_type}
5.2 mobilenetv2_config.yaml
重点关注网络输入的预处理方法:norm_type: ‘data_mean_and_scale’,需要了解的内容已在注释中给出。
特别注意:在开发手册中input_parameters
下的input_layout_rt
参数,可选参数为 NHWC/NCHW
,但经过实验发现,此处参数智能是NHWC
!虽然NCHW
编译不会报错,但生成的.bin
上板模型相比于quantized_model.onnx
模型,精度会很低很多!具体分析过程,详见我的另一篇博客:地平线X3开发板 模型转换期间config.yaml文件中的input_layout_rt踩坑记录
# 模型转化相关的参数
model_parameters:
# ONNX浮点网络数据模型文件
onnx_model: './output/mobilenetv2.onnx'
# 适用BPU架构
march: "bernoulli2"
# 指定模型转换过程中是否输出各层的中间结果,如果为True,则输出所有层的中间输出结果,
layer_out_dump: False
# 日志文件的输出控制参数,
# debug输出模型转换的详细信息
# info只输出关键信息
# warn输出警告和错误级别以上的信息
log_level: 'debug'
# 模型转换输出的结果的存放目录
working_dir: 'model_output'
# 模型转换输出的用于上板执行的模型文件的名称前缀
output_model_file_prefix: 'mobilenetv2_224x224_rgb'
# 模型输入相关参数, 若输入多个节点, 则应使用';'进行分隔, 使用默认缺省设置则写None
input_parameters:
# (选填) 模型输入的节点名称, 此名称应与模型文件中的名称一致, 否则会报错, 不填则会使用模型文件中的节点名称
input_name: ""
# 网络实际执行时,输入给网络的数据格式,包括 nv12/rgb/bgr/yuv444/gray/featuremap,
# pytorch模型一般是rgb
input_type_rt: 'rgb'
# 网络实际执行时输入的数据排布, 可选值为 NHWC/NCHW
# 若input_type_rt配置为nv12,则此处参数不需要配置
# !!!此处必须是NHWC!!!
input_layout_rt: 'NHWC'
# 网络训练时输入的数据格式,可选的值为rgb/bgr/gray/featuremap/yuv444
# pytorch模型一般是rgb
input_type_train: 'rgb'
# 网络训练时输入的数据排布, 可选值为 NHWC/NCHW
# pytorch模型一般是rgb
input_layout_train: 'NCHW'
# (选填) 模型网络的输入大小, 以'x'分隔, 不填则会使用模型文件中的网络输入大小,否则会覆盖模型文件中输入大小
input_shape: ''
# 网络实际执行时,输入给网络的batch_size, 默认值为1
#input_batch: 1
# 网络输入的预处理方法,主要有以下几种:
# no_preprocess 不做任何操作
# data_mean 减去通道均值mean_value
# data_scale 对图像像素乘以data_scale系数
# data_mean_and_scale 减去通道均值后再乘以scale系数
# 注意:此处不是减去均值,除以方差!
norm_type: 'data_mean_and_scale'
# 图像减去的均值, 如果是通道均值,value之间必须用空格分隔
# 注意:此处的均值是没有归一化的均值,例如ImageNet的R通道,应该是: 123.675 = 0.485x255
mean_value: 123.675 116.28 103.53
# 图像预处理缩放比例,如果是通道缩放比例,value之间必须用空格分隔
# 注意:此处的scale是乘以,以前的方差是除以。且是没有归一化数据
# 例如ImageNet的R通道,应该是: 0.0171248 = 1 / (0.229x255)
scale_value: 0.0171248 0.0175070 0.0174292
# 模型量化相关参数
calibration_parameters:
# 模型量化的参考图像的存放目录,图片格式支持Jpeg、Bmp等格式,输入的图片
# 应该是使用的典型场景,一般是从测试集中选择20~100张图片,另外输入
# 的图片要覆盖典型场景,不要是偏僻场景,如过曝光、饱和、模糊、纯黑、纯白等图片
# 若有多个输入节点, 则应使用';'进行分隔
# 预处理后的图片所在路径
cal_data_dir: './data/image_converted_rgb_f32'
# 如果输入的图片文件尺寸和模型训练的尺寸不一致时,并且preprocess_on为true,
# 则将采用默认预处理方法(skimage resize),
# 将输入图片缩放或者裁减到指定尺寸,否则,需要用户提前把图片处理为训练时的尺寸
# preprocess_on: False
# 模型量化的算法类型,支持kl、max、default、load,通常采用default即可满足要求, 若为QAT导出的模型, 则应选择load
calibration_type: 'default'
# 编译器相关参数
compiler_parameters:
# 编译策略,支持bandwidth和latency两种优化模式;
# bandwidth以优化ddr的访问带宽为目标;
# latency以优化推理时间为目标
compile_mode: 'latency'
# 设置debug为True将打开编译器的debug模式,能够输出性能仿真的相关信息,如帧率、DDR带宽占用等
debug: False
# 编译模型指定核数,不指定默认编译单核模型, 若编译双核模型,将下边注释打开即可
# core_num: 2
# 优化等级可选范围为O0~O3
# O0不做任何优化, 编译速度最快,优化程度最低,
# O1-O3随着优化等级提高,预期编译后的模型的执行速度会更快,但是所需编译时间也会变长。
# 推荐用O2做最快验证
optimize_level: 'O3'
运行下方指令:
sh 03_build.sh
重点关注第5列的预先相似度Cosine Similarity
,都在0.9以上,说明转换的还不错。
转换成功后,得到几个文件中比较重要的有:
- 日志文件-
hb_mapper_makertbin.log
- 量化前原始onnx模型-
mobilenetv2_224x224_rgb_original_float_model.onnx
- 量化中间产物:
mobilenetv2_224x224_rgb_optimized_float_model.onnx
- 量化后onnx模型-
mobilenetv2_224x224_rgb_quantized_model.onnx
- 板端模型-
mobilenetv2_224x224_rgb.bin
。
6 在开发机上验证转换过程中生成的两个onnx模型
predict_docker_x3_onnx.py
用在03_build.sh
构建得到.bin
模型之后,用于验证过程产物------两个onnx模型,存放在mobilenetv2_34/
文件夹下。
处理思路很简单:数据预处理–加载模型–模型推理–模型输出后处理,其内容如下:
import numpy as np
import os
from PIL import Image
import matplotlib.pyplot as plt
import json
import cv2
from horizon_tc_ui import HB_ONNXRuntime
def softmax_2D(X):
"""
针对二维numpy矩阵每一行进行softmax操作
X: np.array. Probably should be floats.
return: 二维矩阵
"""
# looping through rows of X
# 循环遍历X的行
ps = np.empty(X.shape)
for i in range(X.shape[0]):
ps[i,:] = np.exp(X[i,:])
ps[i,:] /= np.sum(ps[i,:])
return ps
def check_onnx(onnx_model, img, json_path, input_shape):
## --------------------------------------------#
## opencv实现预处理方式
## --------------------------------------------#
img = cv2.resize(np.array(img), input_shape, interpolation=cv2.INTER_CUBIC).astype(np.float32)
## --------------------------------------------#
# 使用编译过程中生成的onnx模型是不需要归一化的
# 模型需要的数值范围0~255,opencv读取的刚好是0~255
## --------------------------------------------#
# img /= 255.0
## --------------------------------------------#
# 网络训练输入一般是RGB的图片,故在此也转一下
# 为了省时间,似乎这儿可以和yaml中参数配合,去掉这一步
## --------------------------------------------#
img = cv2.cvtColor(img, cv2.COLOR_BGR2RGB)
## ------------------------------------------------------------------#
# 常规操作是:减去均值,除以方差
# 注意:此处和config.yaml中data_mean_and_scale下的mean_value与
# scale_value两个参数重复,不需要进行操作,放在这儿记录一下
## ------------------------------------------------------------------#
# img -= [124.16, 116.28, 103.53]
# img *= [0.0171248, 0.0175070, 0.0174292]
## --------------------------------------------#
# opencv读取的img是HWC格式
# quantized_onnx_model输入格式NHWC
# optimized_float_onnx_model输入格式NCHW
## --------------------------------------------#
if "optimized" in onnx_model:
img = img.transpose(2, 0, 1) # 从HWC,变为CHW
## -------------------------------#
## 添加batch维度
## -------------------------------#
img = np.expand_dims(img, 0)
# --------------------------------#
# class_indict用于可视化类别
# --------------------------------#
with open(json_path, "r") as f:
class_indict = json.load(f)
## -------------------------------#
## 加载onnx模型
## -------------------------------#
ort_session = HB_ONNXRuntime(model_file=onnx_model)
# -----------------------------------#
# onnx模型推理
# 初始化数据,注意此时 img 是numpy格式
# -----------------------------------#
input_name = ort_session.input_names[0]
ort_outs = ort_session.run(None, {input_name: img}) # 推理得到输出
# print(ort_outs) # [array([[-4.290639 , -2.267056 , 7.666328 , -1.4162455 , 0.57391334]], dtype=float32)]
# -----------------------------------#
# 经过softmax转化为概率
# softmax_2D按行转化,一行一个样本
# 测试时,softmax可不要!
# -----------------------------------#
predict_probability = softmax_2D(ort_outs[0])
# print(predict_probability) # array([[0.1],[0.2],[0.3],[0.3],[0.1]])
# ----------------------------------------#
# argmax得到最大概率索引,也就是类别对应索引
# ----------------------------------------#
predict_cla = np.argmax(predict_probability, axis=-1)
# print(predict_cla) # array([2])
print_res = "class: {} prob: {:.3}".format(class_indict[str(predict_cla[0])],
predict_probability[0][predict_cla[0]])
print(print_res)
plt.title(print_res)
for i in range(len(predict_probability[0])):
print("class: {:10} prob: {:.3}".format(class_indict[str(i)],
predict_probability[0][i]))
plt.savefig("./result.jpg")
plt.show()
if __name__ == '__main__':
## ----------------------------------------------------------------#
# 注意,quantized_onnx_model的输入格式为:NHWC
# optimized_float_onnx_model的输入格式为:NCHW
# 这儿的命名一定要以quantized和optimized进行区分,后面的代码中有用到
## ----------------------------------------------------------------#
quantized_onnx_model = './model_output/mobilenetv2_224x224_rgb_quantized_model.onnx'
optimized_float_onnx_model = './model_output/mobilenetv2_224x224_rgb_optimized_float_model.onnx'
# ----------------------------------------#
# 输入图像被resize到什么尺寸
# 分类网络输入尺寸
# ----------------------------------------#
input_shape = (224, 224)
img_path = "./data/tulip.jpg"
assert os.path.exists(img_path), "file: '{}' dose not exist.".format(img_path)
# 下面两行,用它显示图片而已
img = Image.open(img_path)
plt.imshow(img)
img = cv2.imread(img_path)
# read class_indict
json_path = './class_indices.json'
# -----------------------------------------------------------------------#
# 关键部分
# 第一个参数用于切换:quantized_onnx_model 或 optimized_float_onnx_model
# -----------------------------------------------------------------------#
check_onnx(quantized_onnx_model, img, json_path, input_shape)
print("onnx model check finsh.")
运行结果:
-
对于
rose.jpg
的分类预测结果。
使用optimized_float_onnx_model
模型推理
使用quantized_onnx_model
模型推理:
-
对于
tulip.jpg
的分类预测结果
使用optimized_float_onnx_model
模型推理:
使用quantized_onnx_model
模型推理:
图片结果展示:
7 使用hb_perf工具估计在开发板上运行的性能
拿到了.bin
文件,在上开发板运行前,预估一下能运行多少FPS等。
cd到与mobilenetv2_224x224_rgb.bin
同级,运行命令:
hb_perf mobilenetv2_224x224_rgb.bin
生成hb_perf_result
文件夹和hb_perf.log
,打开输出的文件自己看两眼就明白了。
8 附上一些很好的踩坑文章
9 接下来工作
将转换得到的.bin模型在x3开发板上跑起来。
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