gitlab-ci.yml执行出现conda: command not found
记录下自己第一次写gitlab-ci.yml文件的经历。我简单了解了一下CI/CD就准备自己上手看看,果然就遇到了一个错误:conda: command not found。因为实验室都配置好了,所以我不用配置runner和docker,而这也导致了我对CI/CD整个流程的不熟悉以至于碰到问题像个无头苍蝇一样。问了师兄才知道原来gitlab-ci用户并没有安装anaconda,于是我进入服务器给g
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记录下自己第一次写gitlab-ci.yml文件的经历。我简单了解了一下CI/CD就准备自己上手看看,果然就遇到了一个错误:conda: command not found。因为实验室都配置好了,所以我不用配置runner和docker,而这也导致了我对CI/CD整个流程的不熟悉以至于碰到问题像个无头苍蝇一样。
问了师兄才知道原来gitlab-runner用户并没有安装anaconda,于是我进入服务器给gitlab-runner用户安装了anaconda并且配置了环境,当我觉得万事大吉的时候,现实给了我当头一棒,还是conda: command not found这个错误。在参考了https://github.com/conda/conda/issues/7980这篇文章后顺利的解决了这个问题
加入这段代码:
- source ~/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh
- conda activate my_env(自己配置的环境,若没有不需要加)
以下是我测试用的demo
before_script:
- echo "berfore script"
after_script:
- echo "after script"
stages:
- build
- test
build-job:
stage: build
script:
- pwd
- whoami
- source ~/anaconda3/etc/profile.d/conda.sh
- conda list
- conda activate rdkit-env
- python -V
when: always
test-job:
stage: test
script:
- pwd
when: always
其实把这个问题解决以后剩下的部分就简单多了
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