1、TCGA

 

官网地址:  https://portal.gdc.cancer.gov/

小编认为虽然下载数据TCGA官网肯定不如CGDSR或者XENA,但是呢,它的信息最全,有很多稀奇古怪的临床指标都得从这下载。

 

除此之外,一些整体的样本情况,实验和对照信息,临床统计数据,也都一目了然。

 

2、GEPIA  

官网地址:  http://gepia2.cancer-pku.cn/#index

现在工具版本升级到2了,这个支持TCGA所有的样本基因的差异分析,预后分析。

 

GEPIA2还支持TCGA和GTEx联合分析,这对于提升差异的准确性相当友好。如果你的课题涉及到了TCGA数据基因的表达和预后,可以选择这个工具,事半功倍哦。

 

3、cbioportal  

官网地址:  https://www.cbioportal.org/

下载TCGA的突变数据firebrowse或者xena效果更好,但是对突变数据整体评估,单个基因突变预后分析,这个工具更优秀。

 

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