摘要：单细胞数据整合是消除批次效应的关键步骤，本文介绍了三种常用方法：1）CCA整合（Seurat自带），适合多数情况但耗时较长；2）SCTransform预处理后整合，理论上更合理但资源消耗大；3）Harmony降维整合，速度快且效果较好。三种方法均提供R代码实现，支持线粒体基因过滤、数据标准化和聚类分析，参数包括主成分数、基因数阈值等。通过比较不同整合策略，研究者可根据数据规模和分析需求选择合