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bulk转录组专题:如何获得TPM、CPM、FPKM、FPK的数据

由于gfe文件中自带.14这种的版本号,与我们转换的id不同,我们因此需要处理。此外,须获得的基因长度要与exp中的顺序大小一致。转换为以ENSEMBL(ENSG00000121410)为行名的数据框。如果你继续往下做,很可能会遇到一个报错,即使你的文件看不出任何错误。我们首先需要基因的长度。去下面网址下载以下文件。读取了参考数据,最好的方法还是将表达矩阵转为。为行名的RAW_count表达矩阵。

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