生物统计学(biostatistics)第一章绪论定义：用数理统计的原理和方法来分析和解释生物界各种现象和试验调查资料的一门学科生物的特点：随机性、变异性、复杂性•同质(homogeneity)：根据研究目的所确定的观察单位其性质应大致相同。•变异(variation)：即使性质相同的事物，由于存在个体差异，同一指标的测量结果也不同。•总体(population)：具有相同性质的个体所组成的集合，

Data analysis-16sRNA常用V3V4区域进行扩增子测序Basic analytical procedure1.原始数据处理·去除接头序列，并将双端测序序列拼接成单条序列。·根据测序barcode序列区分不同的样本序列。·过滤低质量序列和无法比对到16s rDNA数据库的序列。2.OTU（可执行操作单元）分类和统计·以97%的序列相似度将所有序列进行同源比对并聚类成OTUs (QII

第三章概率分布生物统计学最主要的任务是用样本统计数来推断其所属总体的参数从同一总体中随机抽取样本，每次得到的样本不会完全相同，用不同样本去推断同一总体将得到不同的结论，如何判断这些结论的可靠性•这些推断的基础是关于概率分布的基本知识，以及抽样分布。概率基础知识•必然事件**(certain event)，以U表示。**•不可能事件**(impossible event)，以V表示。**•随机事件*

文章目录High throughput Sequencing基因组计划：**Human Genome Project, HGP**基因组测序方法2.1 鸟枪法测序2.2 新兴的测序技术第一代测序技术第二代测序技术第三代测序技术第四代测序技术2.3 基因组测序的未来High throughput Sequencing高通量测序技术基因组计划：Human Genome Project, HGP人类基因

第二章资料整理与特征数计算资料的类型资料(data)：在生物学试验及调查中能够获得大量的原始数据，是在一定条件下对某种具体事物或现象观察的结果，称之为资料。资料就是变量的值。对某种现象只能观察不能测量的资料一般是由计数和测量得到的。质量性状(qualitative character)资料数量性状(quantitative character)资料花瓣的颜色鱼尾数，玉米籽粒数治疗疾病的痊愈，好转高

生物统计学(biostatistics)第一章绪论定义：用数理统计的原理和方法来分析和解释生物界各种现象和试验调查资料的一门学科生物的特点：随机性、变异性、复杂性•同质(homogeneity)：根据研究目的所确定的观察单位其性质应大致相同。•变异(variation)：即使性质相同的事物，由于存在个体差异，同一指标的测量结果也不同。•总体(population)：具有相同性质的个体所组成的集合，

第四章统计推断（已知样本推总体)文章目录第四章统计推断（已知样本推总体)假设检验的原理与方法样本方差的同质性检验样本平均数的假设检验参数估计上一章我们讨论了已知总体的时候样本的特征，即抽样分布。本章我们来讨论已知样本的时候如何推断总体的特征，主要任务是分析差异产生的原因，是随机误差导致的，还是一些处理效应导致的。假设检验的原理与方法假设检验(hypothesis test)：也叫显著性检验(sig

Linear regression and correlation analysis•第五章中，我们介绍了如何研究两个定性变量是否有关系的问题。•实际工作中，我们经常需要研究两个或两个以上定量变量是否有关系，有怎么样的关系。•对于生物学数据，因为存在随机性和变异性等，所以通常不能推导出确定的函数关系，但是可以使用统计学上的回归与相关分析研究其分布情况(如平均数、标准差和置信区间)。因果关系与平行关

A brief history of bioinformatics 原文DOI号：10.1093/bib/bby063参考链接生物信息学简史-生信自学网A Brief history of Bioinformatics1950–1970: The originsProtein analysis was the starting point生物信息学在DNA中的应用要落后于蛋白质研究将近20年时间，

第五章卡方检验不是所有的样本都可以计算平均数和方差的；例如属性资料的样本，和一些计数资料的样本属性资料计数资料用1. 统计次数法；2. 评分法服从二项分布，则可以利用二项分布的公式来研究其概率分布，有时可近似成正态分布将其转化为计数资料无论是否服从二项分布，都可以使用χ2检验来研究其概率分布χ2检验(chi-square test)①一个样本的方差同质性检验；②适合性检验；只有右尾检验③独立性检验