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Single Cell——转录因子调控网络分析(SCENIC)

SCENIC (Single-Cell rEgulatory Network Inference and Clustering) 是从单细胞RNA数据推断基因调控网络及其相关细胞状态的工具。原作者将SCENIC应用于肿瘤和小鼠大脑单细胞图谱数据,证明了顺式调控网络分析能够有助于深入挖掘细胞异质性背后的生物学意义,并为疾病的诊断、治疗以及发育分化的研究提供有价值的线索。SCENIC在2017年首先发

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生信分析—差异分析,聚类分析,相关性分析

生信中提到的二代数据通常指的是第二代测序数据,即在基因组学研究中使用的第二代高通量测序技术生成的数据。第二代测序技术包括Illumina/Solexa、454/Roche、Ion Torrent等平台,它们通常以高通量、低成本、高准确性和较短的读长为特点。这些技术的出现使得大规模基因组测序成为可能,对于遗传学、演化生物学、临床医学等领域的研究起到了重要的推动作用。表型:生物个体可观测的性状。基因型

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