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数据的质量控制软件----fastQC

​FastQC的基本介绍:FastQC是一款基于Java的软件,它可以快速地对测序数据进行质量评估,其官网为:Babraham Bioinformatics - FastQC A Quality Control tool for High Throughput Sequence Data高通量测序数据的高级质控工具输入FastQ,SAM,BAM文件,输出对测序数据评估的网页报告​

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#linux#运维#服务器
VCF文件通过bgzip和tabix的压缩和索引后转换为.gz后缀的压缩文件和.tbi后缀的索引文件

VCF(Variant Call Format)文件是一种常用于存储基因组变异数据的文件格式。bgzip和tabix是两款常用的工具,分别用于压缩VCF文件和为其建立索引。

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#linux#运维#服务器
报错|使用prefetch下载数据报错处理

初学者在学习过程中总是会遇到很多的报错,我今天在使用prefetch下载数据时提示报错,所以我就查询了大量的信息,所以我就做了一些小总结。一般来说,下载数据出现报错,第一时间应该考虑是否是网络问题。

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#linux
转录组测序分析

组测序原理1.定义2.转录组类型3.普通转录组测序实验流程图-RNA-Seq4.cDNA文库5.文库质控6.上机测序6.1、测序原理-边合成边测序(SBS)1.Flowcell-流动池2.桥式PCR扩增7.得到测试数据五、RNA-seq 应用六、补充---碱基质量值七、需要掌握linux基础知识【以及掌握fa、fq等等数据格式】

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#conda#机器学习#数据分析
到底了