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持续的增殖信号(激活增殖)1、体细胞突变激活下游通路Raf构象变化导致MAPK激活;PI3K催化亚基突变导致AKT/PKB激活;2、下调增殖的负反馈失灵Ras突变导致GTP活性下降,MAPK激活;PTEN缺失导致PIP3减少,PI3K激活;3、增值信号过强引起衰老RAS、MYC、RAF等蛋白过表达引起细胞增殖抑制,导致细胞衰老;逃避生长抑制(逃避抑制)1、抑癌基因缺失RB通...
一、GDCRNATools包下载首先下载R包if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))install.packages("BiocManager")BiocManager::install("GDCRNATools")下载好之后在再官网下载gdc-client工具和manifest文件到当前目录下,具体操作可以...
一、肿瘤的发生:1.突变致癌学说:原癌基因激活:Ras, MYC抑癌基因失活:Rb , p53, PTEN2.肿瘤遵循达尔文进化论: 经历持续的演变过程涉及多个限速步骤多步骤阶段因素肿瘤的进化树肿瘤六大获得性特征1、自给自足的生长信号胞外生长信号的改变跨膜转导受体突变胞内信号通路异常2、逃避细胞凋亡3、持续的血管新生4、潜力无限的复制能力5、组织侵袭转移6、抗生...
声明:以下学习资料根据“生信技能树”网络系列免费教学材料整理而成,代码来自“生信技能树”校长jimmy的github。GEO数据库挖掘系列知识分享课程,于2016年首发于生信菜鸟团博客。配套教学视频在B站,特此声明。前言:关于GEO数据我们的目标是要从读懂文献到复刻文献实验,再到掌握GEO数据挖掘的能力。首先便是要广泛阅读,在读文献时,提炼脉络,读懂文献使用了哪个或哪些GSE数据集,对数据做了..
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数据库简介CCLE数据库几个知识点CCLE中细胞系表达谱的GEO数据库GSE36133CCLE数据库数据下载链接