用的是kaggle上的一个比赛,比赛的大致背景,给了你几个excel表,其中分为训练集、验证集、测试集,训练集和验证集中有三天的患病人数,测试集只有前两天的患病人数,第三天的患病人数被坏人抹掉了,要求你训练个模型,能推测出第三天的患病人数

其实这个代码是适合入门的人学习,训练出来准确率并不高,一个原因是训练轮数太少,其实还有其他改进方法,比如使用正则化,前面的代码是没有改进过的,准确率较低,后面的是改进过后的,使用了正则化,而且不像前面的代码一样,把全部的数据都丢进去训练了,而是选了几列数据,通过计算相关系数,将相关性比较强的那几列数据拿进去训练了

代码中有kaggle链接,里面可以看到原题描述,可以下载数据集,这里只提供代码

'''
这串代码和test.py是一样的
main.py是对这个项目代码的优化
'''

# 自己把代码敲一遍
# pandas是处理csv文件的,csv这个库也可以
# pandas的用法比较高级,以后再讲怎么时候,这次只用csv文件
import pandas as pd
import csv
import torch
import numpy as np
# 画图的
import matplotlib.pyplot as plt
from torch.utils.data import Dataset, DataLoader
import torch.nn as nn
from torch import optim
import time


class CovidDataset(Dataset):
    def __init__(self, file_path, mode):
        with open(file_path, 'r') as f:
            ori_dataset = list(csv.reader(f))
            # 将list其变成array才能切片,然后强制把数据变成float类型,因为里面有单引号,双引号
            csv_data = np.array(ori_dataset)[1:, 1:].astype(float)

            # 创建X和Y,制造训练集和验证集,测试集
            # 逢5取1,如果是训练集就取4份,是验证集就取一份,这里不建议,平常是随机取
            if mode == 'train':
                indices = [i for i in range(len(csv_data)) if i % 5 != 0]
            elif mode == 'val':
                indices = [i for i in range(len(csv_data)) if i % 5 == 0]
            # 测试集是取所有数据
            elif mode == 'test':
                indices = [i for i in range(len(csv_data))]

            # 把没用的第一行和第一列去掉后,[0,92]都是X,[92]是Y
            X = torch.tensor(csv_data[indices, :93])
            if mode != 'test':
                self.Y = torch.tensor(csv_data[indices, 93])
            # 将数据进行标准化,减去均值,除以标准差
            # 标准差是std,方差是var
            self.X = (X - X.mean(dim=0, keepdim=True)) / X.std(dim=0, keepdim=True)
            self.mode = mode

    # 如果是测试集,就只有X没有Y
    # 这里相当于把getitem这个函数重写,给了索引,就返回对应的数据
    def __getitem__(self, item):
        if self.mode == 'test':
            # 这里默认是float64,这里改成float32
            return self.X[item].float()
        else:
            return self.X[item].float(), self.Y[item].float()

    # 返回数据集的长度
    def __len__(self):
        return len(self.X)


# # 康康数据迭代器是不是写好了
# for x,y in train_set:
#     print(x,y)
#     break

class myModel(nn.Module):
    def __init__(self, inDim):
        # 这里是继承,继承父类的方法,然后将父类的方法进行重写
        super(myModel, self).__init__()
        self.fc1 = nn.Linear(inDim, 128)
        self.relu1 = nn.ReLU()
        self.fc2 = nn.Linear(128, 1)

    def forward(self, x):
        x = self.fc1(x)
        x = self.relu1(x)
        x = self.fc2(x)
        if len(x.size()) > 1:
            # 如果维度大于1,就去掉第2个维度
            # 这里输出的x其实就是pred_y,是16*1,为了让二维的16*1变成16
            x = x.squeeze(1)
        return x


def train_val(model, train_loader, val_loader, lr, optimizer, device, epochs, save_path):
    model = model.to(device)
    # 收集损失
    plt_train_loss = []
    plt_val_loss = []
    # 设置一个初始的loss,每次训练就比较一次
    min_val_loss = np.inf

    # 开始训练,模型训练的开始
    for epoch in range(epochs):
        # train方法是nn.Mudule自带的
        model.train()
        stat_time = time.time()
        train_loss = 0.0
        for x, y in train_loader:
            # 模型放在了gpu上,数据也要放在gpu上
            x, y = x.to(device), y.to(device)

            # 梯度清零
            optimizer.zero_grad()

            y_pred = model(x)
            # 一批的损失
            bat_loss = loss(y_pred, y)
            bat_loss.backward()
            optimizer.step()
            # .item就是把张量变成数字
            train_loss += bat_loss.cpu().item()
        plt_train_loss.append(train_loss / len(train_loader))

        # 验证过程
        # .eval是nn.Module中的方法
        model.eval()
        val_loss = 0.0
        # torch.no_grad是为了不产生梯度
        with torch.no_grad():
            for val_x, val_y in val_loader:
                val_x, val_y = val_x.to(device), val_y.to(device)
                y_pred = model(val_x)
                bat_val_loss = loss(y_pred, val_y)
                val_loss += bat_val_loss.cpu().item()
                # 验证是没有更新参数的步骤的
                # 但是数据经过了模型,是会产生梯度
        plt_val_loss.append(val_loss / len(val_loader))

        # 保存最好的那一次
        if val_loss < min_val_loss:
            min_val_loss = val_loss
            torch.save(model, save_path)
        print("[%03d/%03d]%2.2f sec(s) train_loss: %.6f val_loss:%.6f" %
              (epoch + 1, epochs, time.time() - stat_time, train_loss, val_loss))

    # 画图
    plt.plot(plt_train_loss)
    plt.plot(plt_val_loss)
    plt.title("Loss Curve")
    plt.legend(['train_loss', 'val_loss'])
    plt.show()

def evaluate(model_path, test_loader, rel_path, device):
    model = torch.load(model_path).to(device)
    # 保存预测的结果
    rel=[]
    # 测试的时候也是不能算梯度
    model.eval()
    with torch.no_grad():
        for x in test_loader:
            x=x.to(device)
            pred=model(x)
            rel.append(pred.cpu().item())
    # 按照官方规定的方式写csv文件
    with open(rel_path, 'w',newline="") as f:
        csv_writer = csv.writer(f)
        csv_writer.writerow(["id",'tested_positive'])
        # 同时得到 第几个 以及第几个的索引
        for i,pred in enumerate(rel):
            csv_writer.writerow([str(i), str(pred)])

# def mseLoss(pred, target, model):
#     loss = nn.MSELoss(reduction='mean')
#     ''' Calculate loss '''
#     # 正则项,是起到惩罚作用
#     regularization_loss = 0
#     for param in model.parameters():
#         # TODO: you may implement L1/L2 regularization here
#         # 使用L2正则项
#         # regularization_loss += torch.sum(abs(param))
#         # 计算所有参数平方
#         regularization_loss += torch.sum(param ** 2)
#     # 返回本来的loss
#     return loss(pred, target) + 0.00075 * regularization_loss


# 写训练过程
train_file = r'./covid.train.csv'
test_file = r'./covid.test.csv'
train_set = CovidDataset(train_file, mode='train')
val_set = CovidDataset(train_file, mode='val')
test_set = CovidDataset(test_file, mode='test')

batch_size = 16
# nchw输入的x是16*93,输出的pred_y是16*1,y是16是一维的
train_loader = DataLoader(train_set, batch_size=batch_size, shuffle=True)
val_loader = DataLoader(val_set, batch_size=batch_size, shuffle=True)
# 测试集不能打乱,你训练的时候,先训练哪一行无所谓,但是在测试的时候,看excel表,是要按顺序测试的
test_loader = DataLoader(test_set, batch_size=1, shuffle=False)

# for x,y in train_loader:
#     pred_y=model(x)
#     print(x.shape, y.shape, pred_y.shape)

# 损失函数
loss = nn.MSELoss()
# 改用自己写的mseloss
# loss = mseLoss

# 训练轮次
epochs = 20
# 学习率
lr = 0.001
data_dim = 93

device = torch.device("cuda:0" if torch.cuda.is_available() else "cpu")
# print(device)
model = myModel(data_dim).to(device)
save_path = './model_save/best_model.pth'
rel_path='pred.csv'
# 优化器
optimizer = optim.SGD(model.parameters(), lr=lr, momentum=0.9)

train_val(model, train_loader, val_loader, lr, optimizer, device, epochs, save_path)

# 测试过程
evaluate(save_path, test_loader, rel_path, device)

改进过后的代码

'''
代码的优化,这是对test.py代码的优化,准确率更高
'''

import csv
import numpy as np
import time

import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib
# matplotlib.use('Qt5Agg')

import pandas as pd
from torch import optim
import torch.nn as nn
import torch
from torch.utils.data import Dataset,DataLoader

from sklearn.decomposition import PCA
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from sklearn.feature_selection import chi2


'''
计算相关系数,93列并不是每一列都很重要,只选一些很重要的列出来
求每一列和最后一列的线性相关系数
'''
def get_feature_importance(feature_data, label_data, k =4,column = None):
    """
    此处省略 feature_data, label_data 的生成代码。
    如果是 CSV 文件,可通过 read_csv() 函数获得特征和标签。
    这个函数的目的是, 找到所有的特征种, 比较有用的k个特征, 并打印这些列的名字。
    """
    model = SelectKBest(chi2, k=k)      #定义一个选择k个最佳特征的函数
    feature_data = np.array(feature_data, dtype=np.float64)
    # label_data = np.array(label_data, dtype=np.float64)
    X_new = model.fit_transform(feature_data, label_data)   #用这个函数选择k个最佳特征
    #feature_data是特征数据,label_data是标签数据,该函数可以选择出k个特征
    print('x_new', X_new)
    scores = model.scores_                # scores即每一列与结果的相关性
    # 按重要性排序,选出最重要的 k 个
    indices = np.argsort(scores)[::-1]        #[::-1]表示反转一个列表或者矩阵。
    # argsort这个函数, 可以矩阵排序后的下标。 比如 indices[0]表示的是,scores中最小值的下标。

    if column:                            # 如果需要打印选中的列
        k_best_features = [column[i+1] for i in indices[0:k].tolist()]         # 选中这些列 打印
        print('k best features are: ',k_best_features)
    return X_new, indices[0:k]                  # 返回选中列的特征和他们的下标。

# def get_feature_importance_with_pca(feature_data, k=4, column=None):
#     """
#     使用PCA进行特征降维,并找出对前k个主成分影响最大的原始特征。
#
#     参数:
#     feature_data (pd.DataFrame or np.ndarray): 特征数据。
#     k (int): 选择的主成分数目,默认为4。
#     column (list, optional): 特征名称列表。如果feature_data是DataFrame,则可以省略此参数。
#
#     返回:
#     X_new (np.ndarray): 降维后的特征数据。
#     selected_features (list of lists): 对每个主成分影响最大的原始特征及其载荷。
#     """
#     # 如果提供了列名或feature_data是DataFrame,获取列名
#     if column is None and hasattr(feature_data, 'columns'):
#         column = feature_data.columns.tolist()
#     elif column is None:
#         raise ValueError("Column names must be provided if feature_data is not a DataFrame.")
#
#     # 数据标准化
#     scaler = StandardScaler()
#     feature_data_scaled = scaler.fit_transform(feature_data)
#
#     # 应用PCA
#     pca = PCA(n_components=k)
#     X_new = pca.fit_transform(feature_data_scaled)
#     return X_new



class covidDataset(Dataset):
    def __init__(self, path, mode="train", feature_dim=5, all_feature=False):
        with open(path,'r') as f:
            csv_data = list(csv.reader(f))
            column = csv_data[0]
            x = np.array(csv_data)[1:,1:-1]
            y = np.array(csv_data)[1:,-1]
            if all_feature:
                col_indices = np.array([i for i in range(0,93)])                  # 若全选,则选中所有列。
            else:
                _, col_indices = get_feature_importance(x, y, feature_dim, column)      # 选重要的dim列。
                # X_new = get_feature_importance_with_pca(x, feature_dim, column)  # 选重要的特征
            col_indices = col_indices.tolist()             # col_indices 从array 转为列表。
            csv_data = np.array(csv_data[1:])[:,1:].astype(float)       #取csvdata从第二行开始, 第二列开始的数据,并转为float
            if mode == 'train':                                # 训练数据逢5选4, 记录他们的所在行
                indices = [i for i in range(len(csv_data)) if i % 5 != 0]
                self.y = torch.tensor(csv_data[indices,-1])      # 训练标签是csvdata的最后一列。 要转化为tensor型
            elif mode == 'val':               # 验证数据逢5选1, 记录他们的所在列
                indices = [i for i in range(len(csv_data)) if i % 5 == 0]
                # data = torch.tensor(csv_data[indices,col_indices])
                self.y = torch.tensor(csv_data[indices,-1])        # 验证标签是csvdata的最后一列。 要转化为tensor型
            else:
                indices = [i for i in range(len(csv_data))]     # 测试机只有数据
                # data = torch.tensor(csv_data[indices,col_indices])
            data = torch.tensor(csv_data[indices, :])           # 根据选中行取 X , 即模型的输入特征
            self.data = data[:, col_indices]                   #  col_indices 表示了重要的K列, 根据重要性, 选中k列。
            self.mode = mode                                   # 表示当前数据集的模式

            self.data = (self.data - self.data.mean(dim=0,keepdim=True)) / self.data.std(dim=0,keepdim=True)  # 对数据进行列归一化
            assert feature_dim == self.data.shape[1]                   # 判断数据的列数是否为规定的dim列, 要不然就报错。

            print('Finished reading the {} set of COVID19 Dataset ({} samples found, each dim = {})'
                  .format(mode, len(self.data), feature_dim))             # 打印读了多少数据

    def __getitem__(self, item):               # getitem 需要完成读下标为item的数据
        if self.mode == 'test':                  # 测试集没标签。   注意data要转为模型需要的float32型
            return self.data[item].float()
        else :                                  # 否则要返回带标签数据
            return self.data[item].float(), self.y[item].float()
    def __len__(self):
        return len(self.data)                 # 返回数据长度。


class myNet(nn.Module):
    def __init__(self,inDim):
        super(myNet,self).__init__()
        self.fc1 = nn.Linear(inDim, 64)              # 全连接
        self.relu = nn.ReLU()                        # 激活函数
        self.fc2 = nn.Linear(64,1)                     # 全连接

    def forward(self, x):                     #forward, 即模型前向过程
        x = self.fc1(x)
        x = self.relu(x)

        x = self.fc2(x)
        if len(x.size()) > 1:
            return x.squeeze(1)
        else:
            return x




def train_val(model, trainloader, valloader,optimizer, loss, epoch, device, save_):

    # trainloader = DataLoader(trainset,batch_size=batch,shuffle=True)
    # valloader = DataLoader(valset,batch_size=batch,shuffle=True)
    model = model.to(device)                # 模型和数据 ,要在一个设备上。
    plt_train_loss = []
    plt_val_loss = []
    val_rel = []
    min_val_loss = 100000                 # 记录训练验证loss 以及验证loss和结果

    for i in range(epoch):                 # 训练epoch 轮
        start_time = time.time()             # 记录开始时间
        model.train()                         # 模型设置为训练状态
        train_loss = 0.0
        val_loss = 0.0

        for data in trainloader:                     # 从训练集取一个batch的数据
            optimizer.zero_grad()                   # 梯度清0
            x , target = data[0].to(device), data[1].to(device)       # 将数据放到设备上
            pred = model(x)                          # 用模型预测数据
            bat_loss = loss(pred, target, model)       # 计算loss
            bat_loss.backward()                        # 梯度回传, 反向传播。
            optimizer.step()                            #用优化器更新模型。
            train_loss += bat_loss.detach().cpu().item()             #记录loss和

        plt_train_loss. append(train_loss/trainloader.dataset.__len__())
        #记录loss到列表。注意是平均的loss ,因此要除以数据集长度。

        model.eval()                 # 模型设置为验证状态
        with torch.no_grad():                    # 模型不再计算梯度
            for data in valloader:                      # 从验证集取一个batch的数据
                val_x , val_target = data[0].to(device), data[1].to(device)          # 将数据放到设备上
                val_pred = model(val_x)                 # 用模型预测数据
                val_bat_loss = loss(val_pred, val_target, model)          # 计算loss
                val_loss += val_bat_loss.detach().cpu().item()                  # 计算loss
                val_rel.append(val_pred)                 #记录预测结果
        if val_loss < min_val_loss:
            torch.save(model, save_)               #如果loss比之前的最小值小, 说明模型更优, 保存这个模型

        plt_val_loss.append(val_loss/valloader.dataset.__len__())  #记录loss到列表。注意是平均的loss ,因此要除以数据集长度。
        #
        print('[%03d/%03d] %2.2f sec(s) TrainLoss : %.6f | valLoss: %.6f' % \
              (i, epoch, time.time()-start_time, plt_train_loss[-1], plt_val_loss[-1])
              )              #打印训练结果。 注意python语法, %2.2f 表示小数位为2的浮点数, 后面可以对应。
        # print('[%03d/%03d] %2.2f sec(s) TrainLoss : %3.6f | valLoss: %.6f' % \
        #       (i, epoch, time.time()-start_time, 2210.2255411, plt_val_loss[-1])
        #       )              #打印训练结果。 注意python语法, %2.2f 表示小数位为2的浮点数, 后面可以对应。
    plt.plot(plt_train_loss)              # 画图, 向图中放入训练loss数据
    plt.plot(plt_val_loss)                # 画图, 向图中放入训练loss数据
    plt.title('loss')                      # 画图, 标题
    plt.legend(['train', 'val'])             # 画图, 图例

    plt.show()                                 # 画图, 展示





def evaluate(model_path, testset, rel_path ,device):
    model = torch.load(model_path, weights_only=False).to(device)                     # 模型放到设备上。
    testloader = DataLoader(testset,batch_size=1,shuffle=False)         # 将验证数据放入loader 验证时, 一般batch为1
    val_rel = []
    model.eval()               # 模型设置为验证状态
    with torch.no_grad():               # 模型不再计算梯度
        for data in testloader:                 # 从测试集取一个batch的数据
            x = data.to(device)                # 将数据放到设备上
            pred = model(x)                        # 用模型预测数据
            val_rel.append(pred.item())                #记录预测结果
    print(val_rel)                                     #打印预测结果
    with open(rel_path, 'w') as f:                        #打开保存的文件
        csv_writer = csv.writer(f)                           #初始化一个写文件器 writer
        csv_writer.writerow(['id','tested_positive'])         #在第一行写上 “id” 和 “tested_positive”
        for i in range(len(testset)):                           # 把测试结果的每一行放入输出的excel表中。
            csv_writer.writerow([str(i),str(val_rel[i])])
    print("rel已经保存到"+ rel_path)








all_col = False              #是否使用所有的列
device = 'cuda' if torch.cuda.is_available() else 'cpu'       #选择使用cpu还是gpu计算。
print(device)
train_path = 'covid.train.csv'                     # 训练数据路径
test_path = 'covid.test.csv'              # 测试数据路径

file = pd.read_csv(train_path)
file.head()                    # 用pandas 看看数据长啥样

if all_col == True:
    feature_dim = 93
else:
    feature_dim = 6              #是否使用所有的列

trainset = covidDataset(train_path,'train',feature_dim=feature_dim, all_feature=all_col)
valset = covidDataset(train_path,'val',feature_dim=feature_dim, all_feature=all_col)
testset = covidDataset(test_path,'test',feature_dim=feature_dim, all_feature=all_col)   #读取训练, 验证,测试数据

def mseLoss(pred, target, model):
    loss = nn.MSELoss(reduction='mean')
    ''' Calculate loss '''
    regularization_loss = 0                    # 正则项
    for param in model.parameters():
        # TODO: you may implement L1/L2 regularization here
        # 使用L2正则项
        # regularization_loss += torch.sum(abs(param))
        regularization_loss += torch.sum(param ** 2)                  # 计算所有参数平方
    return loss(pred, target) + 0.00075 * regularization_loss             # 返回损失。

loss =  mseLoss           # 定义mseloss 即 平方差损失,

config = {
    'n_epochs': 50,                # maximum number of epochs
    'batch_size': 256,               # mini-batch size for dataloader
    'optimizer': 'SGD',              # optimization algorithm (optimizer in torch.optim)
    'optim_hparas': {                # hyper-parameters for the optimizer (depends on which optimizer you are using)
        'lr': 0.0001,                 # learning rate of SGD
        'momentum': 0.9              # momentum for SGD
    },
    'early_stop': 200,               # early stopping epochs (the number epochs since your model's last improvement)
    'save_path': 'model_save/model.pth',  # your model will be saved here
}

model = myNet(feature_dim).to(device)                      # 实例化模型
optimizer = optim.SGD(model.parameters(), lr=0.001,momentum=0.9)             # 定义优化器
trainloader = DataLoader(trainset, batch_size=config['batch_size'],shuffle=True)
valloader = DataLoader(valset, batch_size=config['batch_size'],shuffle=True)  # 将数据装入loader 方便取一个batch的数据

train_val(model, trainloader, valloader, optimizer, loss, config['n_epochs'], device,save_=config['save_path'])  # 训练


evaluate(config['save_path'], testset, 'pred.csv', device)           # 验证

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