你还陷入在生信不知如何分析四处求人的境地当中吗？无穷无尽的报错和代码调试，也让你苦不堪言？

生信分析的门槛，正在悄悄被AI打碎。

从此，AI 不是一个臃肿的软件，而是为 AI agents 量身定制的科研大脑。

今天，我们用一个真实的差异表达+富集分析案例，带你领略生信分析的惊人效率。

一、现场直击：从原始数据到 7 张出版级图表

我们向AI发起挑战，首先，输入指令如下：

> 请你帮我根据D:\微信\WeChat Files\xwechat_files\wxid_6s9t3ivb381g12_a7a6\msg\file\2026-03\genes_expression_class_code_anno_count(1).txt做一个富集分析图

● 让我先读取这个文件，了解数据格式。

  Reading 1 file… (ctrl+o to expand)

  ⎿  D:\微信\WeChat

 Do you want to proceed?

 > 1. Yes

   2. Yes, allow reading from 2026-03/ during this session

   3. No

下一步进行差异表达分析方法的选择：

←  [×] 比较组  [ ] 差异基因筛选  √ Submit  →

差异表达分析用哪种方法？

> 1. DESeq2（推荐）

     负二项分布模型，适合count数据，统计最严谨

  2. edgeR

     同样适合count数据，速度稍快

  3. 简单fold-change + t-test

     不安装Bioc包，直接用log2CPM，速度最快

  4. Type something.

选择富集分析的类型：

←  [×] 比较组  [ ] 分析类型  √ Submit  →

富集分析类型？

> 1. GO富集（柱状图）

     GO term 富集分析，展示 BP/MF/CC

  2. KEGG富集（柱状图）

     KEGG pathway 富集分析

  3. GO + KEGG 都做

     同时生成 GO 和 KEGG 富集图

  4. Type something.

进行分析（还能自动下载一些本地没有的R包，简直不要太方便！）

 Do you want to create enrichment_analysis.py?

 > 1. Yes

   2. Yes, allow all edits during this session (shift+tab)

   3. No

生成结果如下：

● 全部成功。生成了以下文件：

  图片（7张）

  - GO_enrichment_combined.png — GO 综合柱状图（BP/MF/CC 三色）

  - GO_BP_enrichment.png — 生物过程（BP）柱状图

  - GO_MF_enrichment.png — 分子功能（MF）柱状图

  - GO_CC_enrichment.png — 细胞组分（CC）柱状图

  - GO_enrichment_dotplot.png — GO 气泡图（点大小=基因数）

  - KEGG_enrichment.png — KEGG 通路柱状图

  - KEGG_enrichment_dotplot.png — KEGG 气泡图

  结果表（2个）

  - GO_enrichment_results.csv

  - KEGG_enrichment_results.csv

而且还有分析流程的简要描述，也是一个很好的生信学习材料：

  分析流程简述：

  1. CPM 过滤低表达基因（保留 14,954 个）

  2. log2CPM + t-test + BH 校正，筛出 DEG（530 个，|log2FC|≥1, padj<0.05）

  3. Fisher's exact test 做 GO/KEGG 富集，BH 校正

  4. GO 显著 103 条，KEGG 显著 64 条

GO 富集分析结果如下：

KEGG富集分析结果如下：

随后小编又尝试“使用R语言去进行火山图的绘制”，也运行的非常迅速成功，如下：

它的优势在于：

1. 它是 AI 的“百科全书”

从基础的序列比对、引物设计，到前沿的单细胞轨迹分析、空间转录组去卷积，甚至临床数据库 ClinVar 的查询，实现了全流程覆盖。

2. 它是 AI 的“避坑指南”

生信代码最怕版本不兼容。bioSkills 在每个技能描述中都包含了 Version Compatibility，强制要求 AI 生成正确、规范、可执行的代码。

如果说过去AI是“会写代码的实习生”，那么现在将是：懂得任务结构的生信辅助画图小能手！

如果你准备认真尝试“AI + 生信”，百沐将是你绝对不容错过的底层武器。