Centos 服务器安装CPU并行Lammps

step1 建立主机与服务器连接

下载Xmanager Suite套装并在主机中安装，通过套装中的Xshell建立主机与服务器的连接，通过Xftp向服务器传输文件。之前用的是PuTTY，发现Xmanager更好用。

step2 安装Lammps

主要参考Lammps的官方文档：https://lammps.sandia.gov/doc/Install_linux.html#epel

step 2.1 安装Lammps

官方文档给出的是zypper install lammps，但是zypper是openSUSE的命令行包管理器，Centos系统应该用yum install lammps。

step2.2 运行测试文件

官方文档给出的是mpirun -np 2 lmp -in in.lj，官方默认已经安装好OpenMPI，并加载OpenMPI模块。但是并不是服务器都满足这个条件。接下来，给服务器安装OpenMPI，并加载OpenMPI模块。
第1步 安装OpenMPI yum install openmpi
第2步 加载OpenMPI模块 yum install environment-modules
可以通过module avail查看有哪些模块可用。输出结果可以看到/etc/modulefiles中有mpi/openmpi-x86_64可用。输入module add mpi/openmpi-x86_64加载模块，module list 可以查看当前加载的模块。
module avail
通过Xftp从主机向服务器传输lammps测试文件in.lj。运行mpirun -np 2 lmp -in in.lj，可以看到输出。

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