此文是基于网上众多ffmpeg资料写的，其中有稍微的改动，比如MP4格式一定要是使用libx264与baseline的，获取的路径处理，（linux与Windows不同）

package com.xincheng.utils;


import java.io.BufferedReader;
import java.io.File;
import java.io.IOException;
import java.io.InputStream;
import java.io.InputStreamReader;
import java.io.UnsupportedEncodingException;
import java.net.URLDecoder;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Calendar;
import java.util.List;


import org.slf4j.Logger;
import org.slf4j.LoggerFactory;


import com.xincheng.config.SystemConfig;
import com.xincheng.log.LoggerUlog;




public class videoSwitchUtils {
private static Logger logger = LoggerFactory.getLogger(videoSwitchUtils.class);
public static String process(String resourcePath,String uploadList) {  
        int type = checkContentType(resourcePath);  
        String status = null;  
        if (type == 0) {  
            status = processFLV(resourcePath,uploadList);// 直接将文件转为mp4文件  
        } else if (type == 1) {  
            status = processFLV(resourcePath,uploadList);// 将rmvb转为mp4
            
        }  
        return status;  
    }  
  
    private static int checkContentType(String resourcePath) {  
        String type = resourcePath.substring(resourcePath.lastIndexOf(".") + 1, resourcePath.length()).toLowerCase();  
        // ffmpeg能解析的格式：（asx，asf，mpg，wmv，3gp，mp4，mov，avi，flv等）  
        if (type.equals("avi")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("mpg")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("wmv")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("3gp")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("mov")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("mp4")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("asf")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("asx")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("flv")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("mpeg")) {  
            return 0;  
        } else if (type.equals("mpe")) {  
            return 0;  
        }  
        // 对ffmpeg无法解析的文件格式(wmv9，rm，rmvb等),  
        // 可以先用别的工具（mencoder）转换为avi(ffmpeg能解析的)格式.  
        else if (type.equals("wmv9")) {  
            return 1;  
        } else if (type.equals("rm")) {  
            return 1;  
        } else if (type.equals("rmvb")) {  
            return 1;  
        }  
        return 9;  
    }  
  
    private static boolean checkfile(String path) {  
        File file = new File(path);  
        if (!file.isFile()) {  
            return false;  
        }  
        return true;  
    }  
  
    // ffmpeg能解析的格式：（asx，asf，mpg，wmv，3gp，mp4，mov，avi，flv等）  
    @SuppressWarnings("unchecked")  
    private static String processFLV(String resourcePath,String uploadList) {  
        if (!checkfile(resourcePath)) {  
            System.out.println(resourcePath + "   is   not   file");  
            LoggerUlog.error(resourcePath+"无法解析", "1I4999");
            return null;  
        }  
        // 文件命名  
        Calendar c = Calendar.getInstance();  
        String savename = DateUtils.transitionDate();//String.valueOf(c.getTimeInMillis()) + Math.round(Math.random() * 100000);  
        List commend = new ArrayList();  
        String oldName = "";
        String transformPath = "";
      // resourcePath = resourcePath.substring(1);
        if(resourcePath.contains("//")){
        resourcePath = resourcePath.replaceAll("//", "/");
        }
        if(resourcePath.contains("/")){
        oldName = resourcePath.substring(resourcePath.lastIndexOf("/")+1).substring(0,resourcePath.substring(resourcePath.lastIndexOf("/")+1).indexOf("."));
        transformPath = resourcePath.substring(0,resourcePath.lastIndexOf("/")+1);
        }else{
        oldName = resourcePath.substring(resourcePath.lastIndexOf("\\")+1).substring(0,resourcePath.substring(resourcePath.lastIndexOf("\\")+1).indexOf("."));
        transformPath = resourcePath.substring(0,resourcePath.lastIndexOf("\\")+1);
        } 
//        String path = SystemConfig.class.getClassLoader().getResource("").getPath() + "ffmpeg/ffmpeg.exe";
        logger.info("读取转换工具路径");
        String path = "";
try {
path = SystemConfig.getPara("TransformTool");
} catch (Exception e2) {
// TODO Auto-generated catch block
e2.printStackTrace();
logger.info("读取转换工具路径失败");
} 
//        String path = "/mnt/ffmpeg/ffmpeg_3_3_4/ffmpeg"; 
try {
// 路径解码，主要解决空格%20
path = URLDecoder.decode(path, "UTF-8");
transformPath = URLDecoder.decode(transformPath, "UTF-8");
} catch (UnsupportedEncodingException e1) {
// TODO Auto-generated catch block
e1.printStackTrace();
} 
logger.info("当前路径为：----------"+path);
        commend.add(path);  
        commend.add("-i");  
        commend.add(resourcePath);  
        commend.add("-f");  
        commend.add("mp4");  
        commend.add("-acodec");  
        commend.add("aac");  
       /* commend.add("-b");  
        commend.add("512k");  
        commend.add("-ab");  
        commend.add("512k");*/  
        commend.add("-vcodec");
        commend.add("libx264"); 
        commend.add("-profile:v");
        commend.add("baseline");
        commend.add(transformPath + oldName+"-"+savename + ".mp4");  
        
    try {
        ProcessBuilder builder = new ProcessBuilder();
        builder.command(commend);
        builder.redirectErrorStream(true);
        long start = System.currentTimeMillis(); // 记录起始时间
        
        logger.info("视频转码开始...");
        // builder.start();
        Process process = builder.start();
        
        BufferedReader br = new BufferedReader(new InputStreamReader(process.getInputStream()));
        String line = null;
        while((line = br.readLine()) != null){
        logger.info("视频转换中："+line);
        }
       /* InputStream in = process.getInputStream();
        byte[] re = new byte[1024];
        logger.info("正在进行转码，请稍候"); 
        while (in.read(re) != -1) {
        System.out.print(".");
        }
        System.out.println("");
        in.close();*/
        logger.info("视频转码完成...");
        long end = System.currentTimeMillis();//取结束时间
    logger.info("转码一共运行" + (end - start) + "毫秒");
    logger.info("转换后视频存放路径transformPath："+transformPath + oldName+"-"+savename + ".mp4");
        return transformPath + oldName+"-"+savename + ".mp4";
    } catch (Exception e) {
        e.printStackTrace();
        logger.info("视频转码失败！");
        LoggerUlog.error("视频转码失败！"+resourcePath, "1I4999");
        return null;
    } 
    }  
    
//    @SuppressWarnings("static-access")
public static void main(String[] args) {
// videoSwitchUtils vs = new videoSwitchUtils();
// String resourcePath = "/D:/zhuoqin/double/apache-tomcat-7.0.52/webapps/videoQuartz/WEB-INF/classes/temp/20171116/TransferList/18/21_20171108181122.3gp";
// String uploadList = "D:/zhuoqin/double/test/";
// String path = vs.process(resourcePath,uploadList);
// System.out.println(path);
// String transformPath = resourcePath.substring(0,resourcePath.lastIndexOf("/")+1);
// System.out.println(transformPath);
// String n = "/D:/zhuoqin/double/apache-to".substring(1);
// System.out.println(n);
}
     
}