在运行时，Servlet容器的类加载器先加载classes目录下的类，再加载lib目录下的JAR文件中的类。因此，如果两个目录下存在同名的类，classes目录下的类具有优先权。

我们注意到Tomcat的安装目录下也有一个lib目录，这个与Web应用中的lib目录的区别在于：
Tomcat的lib子目录：存放的JAR文件不仅能被Tomcat访问，还能被所有在Tomcat中发布的JavaWeb应用访问。
JavaWeb应用的lib子目录：存放的JAR文件只能被当前JavaWeb应用访问。
假如Tomcat类加载器要加载一个MyClass的类，它会按照以下先后顺序到各个目录中去查找MyClass的class文件，直到找到为止，如果所有目录中都不存在MyClass.class的文件，则会抛出异常：
1、在JavaWeb应用的WEB-INF/classes中查找MyClass.class文件。
2、在JavaWeb应用的 WEB-INF/lib目录下的JAR文件中查找MyClass.class文件。
3、在Tomcat的lib子目录下直接查找MyClass.class文件。

4、在Tomcat的lib子目录下JAR的文件中查找MyClass.class文件。

Note：
Tomcat6.x与Tomcat5.x的目录结构有所区别。在Tomcat5.x版本中，Tomcat允许在server/lib目录、common/lib和shared/lib目录下存放JAR文件，这3个目录的区别在于：
在server/lib目录下的JAR文件只可被Tomcat访问。
在shared/lib目录下的JAR文件可以被所有的JavaWeb应用访问，但不能被Tomcat访问。
在common/lib目录下的JAR文件可以被Tomcat和所有JavaWeb应用访问。