.Net
开发工具：visual studio
开发语言：C#（最优），C++，VB
数据库：SQLServer（最优）
服务器：Windows Server，Linux（MVC5.0+）
部署工具：IIS，其他（MVC5.0+）
MVC框架：MVC3.0+
ORM：Framework

Java
开发工具：eclipse,myeclipse
开发语言：Java
数据库：MySQL，Oracle
服务器：Linux，Windows Server
部署工具：Tomcat，Weblogic，Nginx
MVC框架：SpringMVC，Struts
ORM框架：Mybatis，Hibernate

工具：VS最好的IDE之一，开发效率，界面友好性远远优于Java的开发工具。

语言：Java所有高级语言的模板，地位毋庸置疑，但后期更新不如人意。lambda表达式在Java1.8中才得到支持，早在11年左右C#便支持该功能了，整整晚了5，6年。Java语言对Windows系统底层支持不友好，打印就是个老大难的问题，根本原因Windows不开源，其他语言无法获取底层打印接口（Java B/S打印解决方案参考 http://blog.csdn.net/lishengko/article/details/56834757）。

数据库：若数据库吞吐量较大，Oracle的性能明显优于SQLServer。

服务器：.Net MVC5.0-服务器只能用Windows操作系统，正版Windows Server+SQLServer大约1万RMB左右，成本较高，新版的MVC6.0+可以在Linux，MAC上运行。

部署工具：IIS效率不高，灵活性差，可配置选项很少，无法通过配置文件方式完成项目部署。JavaB/S项目的部署工具就很灵活了，甚至可以实现多工具部署。如Nginx实现静态资源文件解析，Tomcat实现JavaWeb程序，.jsp页面解析。

MVC框架：.NetMVC3.0+才真正实现了前台页面View层与后台逻辑Controller层的分离，结构语法与SpringMVC类似。比较之下，.NetMVC上手更容易，VS中新建MVCWeb项目即可，无需配置文件。

ORM框架：.NetFramework框架对除SQLServer其他数据库的支持特别不友好，若将数据库改为其他数据库，需另行下载相关插件，生成的代码结构很复杂，大量无用的配置信息，开发效率大大降低。

总结：
微软平台上述所有技术框架，开发部署工具等均出自官方，无需整合，下载安装即可。开发效率高，学习成本低，项目结构清晰，但扩展性差，只有新版的 .netMVC5.0+ 可以实现跨平台。
Java平台就比较灵活了，技术选择方案多，对服务器，部署工具，数据库均为必需要求。但其需要复杂的配置文件去协同各个框架及工具，学习成本较高，初学者很容易迷糊。

.net研究跨平台解决方案时，java已经在研究大数据，分布式解决方案了（hadoop，zookeeper），差的不是一点半点。
若开发人员只想安逸度日，.net首选。若想在编程的路上走的更远，必然是java了。