传统研究容易把淋巴结看作肿瘤细胞扩散路径中的一个节点，但该研究提示，LN.met区域不仅有肿瘤细胞出现，还伴随髓系细胞、CAF、Treg、T细胞和B细胞生态位的系统性变化。发现队列纳入78例HNSCC患者，样本覆盖原发肿瘤、LN.met、LN.adjacent和LN.benign，研究者构建390个核心组织区域和3张TMA，并用PCF（CODEX）检测53种抗体，解析150多万个细胞和21种主要细

近期，《Cell》发表了一项题为“Persistent T cell activation and cytotoxicity against glioblastoma following single oncolytic virus treatment in a clinical trial”的论文，这项研究围绕单次溶瘤疱疹病毒干预后的复发性GBM样本，利用PCF（CODEX）、Xenium和TC

Cell》这项胶质母细胞瘤（GBM）研究之所以具有方法学参考价值，是因为它将PCF（CODEX）空间单细胞蛋白组、Xenium空间转录组和TCR测序放在同一研究框架中：PCF观察蛋白表型和细胞邻近关系，Xenium解析基因表达状态和空间梯度，TCR测序追踪T细胞克隆扩增来源。文献提出的问题正是多层次的：T细胞是否进入肿瘤实质、是否保持功能状态、是否来自既存克隆扩增、是否与肿瘤细胞形成近距离接触，以

Cancer Cell》这项研究提供了一个方法学升级范例：研究者不仅比较细胞类型组成，还进一步分析这些细胞在组织中的邻域、交互和社区结构。PCF80 的80个抗体Panel的意义并不只是“指标更多”，而是让研究者能在同一张组织切片中同步看见细胞类型、结构边界、功能状态和邻域关系，将一个病理观察对象转化为可量化、可比较的组织微环境单元。如果与传统单指标免疫染色或非空间组学相比，PCF（CODEX）这

空间转录组测量的是mRNA空间表达。PCF（CODEX）空间单细胞蛋白组检测的是预先选定的特定蛋白质，可以在组织切片上同时成像数十种蛋白质，并精确分析它们的共定位关系，可以一次性解析多种细胞类型的复杂空间互作。研究使用Stereo-seq对中期妊娠胎盘基底板样本进行空间全转录组测序，重建大规模空间转录组图谱，并开展空间共现、细胞群落、细胞间通讯和拟时序分析。对于母胎界面研究而言，这种对比升级的核心

空间转录组测量的是mRNA空间表达。PCF（CODEX）空间单细胞蛋白组检测的是预先选定的特定蛋白质，可以在组织切片上同时成像数十种蛋白质，并精确分析它们的共定位关系，可以一次性解析多种细胞类型的复杂空间互作。研究使用Stereo-seq对中期妊娠胎盘基底板样本进行空间全转录组测序，重建大规模空间转录组图谱，并开展空间共现、细胞群落、细胞间通讯和拟时序分析。对于母胎界面研究而言，这种对比升级的核心

研究使用Xenium、CosMx、Visium、Visium HD等空间转录组平台，同时加入PCF（CODEX）空间单细胞蛋白组，并通过H&E连续切片和图像配准重建虚拟3D组织。作为基于80抗体Panel的空间单细胞蛋白组方案，可以在空间转录组发现之后，进一步补充细胞类型、功能状态和邻域关系的蛋白层证据。的价值不是取代空间转录组，而是与其形成互补，让“基因表达线索”更接近“组织中细胞实际行为”的解

双抗夹心法芯片配合标准品使用，还可实现多种细胞因子的绝对定量。[20]. Chen Z, You L, Wang L, et al. Dual effect of DLBCL-derived EXOs in lymphoma to improve DC vaccine efficacy in vitro while favor tumorgenesis in vivo. J. Exp. Clin.

“同片”空间多组学技术IN-DEPTH及SGCC计算方法

Cell新期刊《Cell Press Blue》发表首个口腔组织微环境的空间单细胞图谱