前3篇文章都是对比和 Illumina 芯片有关的原始数据格式，这篇则直接比较和 Affymetrix 芯片有关的原始数据格式。目前国内常见的测序机构里，23魔方主要使用与 Affymetrix 有关的定制芯片，据说新版也用了 Illumina 定制芯片，但真实性未知。而其他测序公司比如微基因、各色等，基本都使用或者改用 Illumina 的芯片（微基因的1.0版用 Affymetrix 的定制芯

近几年内，很多国外测序公司（比如23andMe、FTDNA等），他们将类似于 Illumina Omni Express 芯片或其他的位点集替换成了类似于 Illumina GSA 芯片的位点集，且它们一般体现为定制芯片数据。特此，我做了一些对比图，以方便查找哪些芯片格式更接近 GSA（Global Screening Array）的位点集。为了方便对比，我也加入了几种近似于GSA位点集的对照格式