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R、冗余分析(RDA)、ggplot2 在生态环境领域中,冗余分析(RDA)是我们常用的分析方法,分析目的为“解释变量”对“响应变量”的影响情况。类似RDA的方法,还有CCA。这里以RDA为例→数据处理、分析过后,我们需要对结果进行可视化,R语言ggplt2程序包无疑是可视化神器,然而,怎样利用ggplot2对RDA结果进行可视化,需要我们对RDA结果进行了解,提取需要展示的元素。libra...
傻瓜式安装QIIME2安装平台:WSL+Ubuntu 20.04 LTS+Minicondayml文件下载”q2“插件下载安装”q2“类型插件总结安装平台:WSL+Ubuntu 20.04 LTS+MinicondaQIIME2的安装网上已有许多优秀教程,本教程基于win10下的Linux(Ubuntu 20.04 LTS)平台、miniconda环境下完成,WSL好处优于虚拟机(大佬们可自己..
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软件安装与路径添加 在涉及到物种或基因组间差异分析的方法中,LEfSe是目前常见的方法。LEfSe实现的方式主要有在线分析和本地分析,在线分析会受到网络及其他因素影响,因而速度可能极慢。本地分析可基于Windows或Linux系统,调参更加灵活。本文以Windows系统为例,向大家展示如何在自己的本本上运行LEfSe,再也不用去求公司了…… 首先,我们要安装好Pyhthon(2.7版本)和R(..







