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Fst的计算原理与实战

概念回顾Fst:群体间遗传分化指数,是种群分化和遗传距离的一种衡量方法,分化指数越大,差异越大。适用于亚群体间多样性的比较。用于衡量种群分化程度,取值从0到1,为0则认为两个种群间是随机交配的,基因型完全相似;为1则表示是完全隔离的,完全不相似。它往往从基因的多样性来估计,比如SNP或者microsatellites(串联重复序列一种,长度小于等于10bp)。是一种以哈温平衡为前提的种群遗传学统计

Tajima‘s D群体遗传

Tajima’s D 中性检测的指标Tajima’s D是由日本研究员田田文雄(Fumio Tajima)创建的群体基因检验统计数据。D的计算方法是两种遗传多样性测量值之间的差异:成对差异的平均数量和分离位点的数量,每个都按比例调整,以便在中等规模的恒定大小的群体中预期它们是相同的。Tajima’s D检验的目的是区分随机演变的DNA序列(“中性”)和在非随机过程中演化的DNA序列,包括定向选择或

#算法#perl
linux命令mv移动多个文件

llinux命令mv同时移动多个文件:mv可以把多个文件移动到一个文件夹(目录)里面,比如:有a b c三个文件,一个目录d,用下面命令就能将a b c移动到d中$ mv a b c d需要注意的是,目录d必须在最后面,而且它前面不能再出现其他目录也可以使用带选项的mv命令,把多个文件移动到一个目录中,如$ mv a b c -t d$ mv -t d a b c其中,-t后面紧接着...

让老照片重现光彩:Bringing Old Photos Back to Life(实战)

Bringing Old Photos Back to Life香港城市大学和微软亚洲研究院的“让老照片重现光彩”(Bringing Old Photos Back to Life)项目侧重于对老照片进行划痕修复和人脸效果增强,在老照片处理方面取得了很好的成绩,在这篇文章里我们介绍一下这个项目。论文地址:https://arxiv.org/abs/2004.09484Github项目:https:

if __name__ == ‘__main__‘ 如何正确理解?

if name == ‘main’ 如何正确理解?通俗的理解__name__ == ‘main’:假如你叫小明.py,在朋友眼中,你是小明(name == ‘小明’);在你自己眼中,你是你自己(name == ‘main’)。if name == 'main’的意思是:当.py文件被直接运行时,if name == 'main’之下的代码块将被运行;当.py文件以模块形式被导入时,if name

linux计算与检查md5值

md5sum – 计算检验MD5效验码md5sum命令采用MD5报文摘要算法(128位)计算和检查文件的校验和。一般来说,安装了Linux后,就会有md5sum这个工具,直接在命令行终端直接运行。linux中每个文件都会有1个md5值。当两个文件的md5值相同,表示这两个文件完全相同。md5值常用于大型文件的完整性检查,即给予方给出文件的同时给出md5值,接收方收到文件后再次计算md5值,如果两个

#运维#服务器#linux
awk按照多个分隔符进行分割

awk按照指定分隔符进行分割awk默认的分隔符为空格和tab。

#linux#大数据#运维
Linux获取目录中文件名及文件所在目录的方法

通常的操作是由路径中提取出文件名,从路径中提取出目录名,提取文件后缀名等等。例如,从路径/dir1/dir2/file.txt中提取也文件名file.txt,提取出目录/dir1/dir2,提取出文件后缀txt等。一、使用${}1. ${var##*/}该命令的作用是去掉变量var从左边算起的最后一个’/'字符及其左边的内容,返回从左边算起的最后一个’/’(不含该字符)的右边的内容。使用例子及结果

#linux#bash#运维
到底了