一般a.sh等脚本文件可以很容易的将a.sh的echo等数据输出到文本文件，如：

./a.sh >1.txt

但是无法将脚本文件调用函数的输出值输出到文件

可以使用%>:

hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310/test$ ./a.sh %> 1.txt


a.sh代码： 

hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310/test$ cat a.sh 
#!/bin/bash
echo "hello"
bwa aln ../GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna ../SRR003161h20.fastq > SRR003161h20t1.sai
bwa请参考其他文章

查看： 

hadoop@Mcnode1:~/cloud/adam/xubo/data/test20160310/test$ cat 1.txt 
hello
[bwa_aln] 17bp reads: max_diff = 2
[bwa_aln] 38bp reads: max_diff = 3
[bwa_aln] 64bp reads: max_diff = 4
[bwa_aln] 93bp reads: max_diff = 5
[bwa_aln] 124bp reads: max_diff = 6
[bwa_aln] 157bp reads: max_diff = 7
[bwa_aln] 190bp reads: max_diff = 8
[bwa_aln] 225bp reads: max_diff = 9
[main] Version: 0.7.12-r1039
[main] CMD: bwa aln ../GCA_000001405.15_GRCh38/GCA_000001405.15_GRCh38_full_analysis_set.fna ../SRR003161h20.fastq
[main] Real time: 32.801 sec; CPU: 4.116 sec


Logo
Linux

更多推荐

网卡速率和双工模式的配置

http://linux.chinaitlab.com/system/792187.html1、mii-tool 配置网络设备协商方式的工具；    1.1 mii-tool 介绍；    mii-tool - view, manipulate media-independent interface status （mii-tool 是查看，管理介质的网络接口的状态）

avatar Linux

Linux虚拟文件系统之文件系统卸载（sys_umount())

Linux中卸载文件系统由umount系统调用实现，入口函数为sys_umount()。较于文件系统的安装较为简单，下面是具体的实现。1. /*sys_umont系统调用*/2. SYSCALL_DEFINE2(umount, char __user *, name, int, flags)3. {4.struct path path;

avatar Linux

Linux系统下超级终端Minicom的使用方法（例如：连接交换机，路由器等）转http://baike.baidu.com/view/2911642.htm?fr=ala0_1

<br />　　Linux系统下超级终端Minicom的使用方法 <br />　　Linux下的Minicom的功能与下的超级终端功能相似，适于在通过超级终端对设备的管理以及对嵌入操作系统的升级，现写出Minicom的使用手册： <br />　　1． 启动minicom <br />　　以root权限登录系统 <br />　　使用命令 <br />　　minicom –s 则minicom启动，屏

avatar Linux