conda安装什么软件都非常方便,所以,用conda镜像制作docker,可以方便安装一堆东西,代码如下:

FROM continuumio/miniconda3

MAINTAINER chendz@live.com

RUN conda config --add channels bioconda \
    && conda config --add channels conda-forge \
    && conda update -n base -c defaults conda \
    && conda install -y bwa \
    && conda install -y samtools \
    && conda install -y java-jdk==8.0.112 \
    && conda install -y genefuse \
    && conda install -y fastp \
    && conda install -y gencore \
    && conda install -y genefuse \
    && conda install -y zip \
    && conda clean -y --all \
    && mkdir -p /usr/soft


CMD [ "/bin/bash" ]

什么科学计算的工具都可以安装,非常方便

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