小庞统计——R语言生存数据机器学习预测模型3.0版本正式发布!(付费获取)此代码是继2.0版本的基础上进行了优化,绘图质量、模型内容进一步提升,增加所有生存模型(RSF、Cox、GBM、Coxboost、Survivalsvm、Xgboost 、Superpc、plsRcox)的SHAP解释,网页制作版本(对接所有生存模型的网页制作,后续更新)。目前该版本是多种机器学习组合,多方面评价,以及所有模型SHAP解释的全新版本,涵盖大多数生存机器学习的内容,在工作量,以及质量上都有进一步提升。

目前我们的代码依旧是简单操作,即可实现生存机器学习的全流程。

只用准备好自己的数据,确定自己的研究方向。即可复现以下过程

根据目前SCI发表的文章,进行了正常流程的代码编写,从开始的数据数据集划分,基础表格,单因素分析,以及单因素、多因素Cox回归结果表格制作,均有代码生成。

模型评价包含,时间依赖AUC(各个生存时间点的AUC评价),校准曲线、ROC曲线、C-index;

最终可以根据模型的预测值将患者划分为高低风险组,并评价不同风险组患者的生存差异,并绘制K-M生存曲线。

可以通过对多种生存机器学习进行shap解释,确定最佳的预后变量。

由于工作量以及技术难度的提升,本次整套代码价格389元!!!(获取私信联系)!通过运行代码,即可得到以下结果:

毋庸置疑,本次依然是全程售后

以下给出代码的部分运行结果图:

单因素多因素Cox回归结果表格(Cox确定预后因果关系变量)

常用过滤过拟合变量筛选变量方法:Lasso筛选变量

传统Nomogram列线图的绘制

构建多个机器学习模型,对比AUC以及Cindex

绘制不同模型不同年份的ROC曲线展现模型性能

绘制校准曲线,展现各个模型的拟合效果

通过临床获益DCA曲线,评价各个模型在不同生存概率下的临床获益情况

通过对比各个模型的shap重要性解释,来评价重要预后变量,并且可以解释生存机器学习黑盒原理

单个样本中各个变量的SHAP解释

通过偏相关依赖图,展示临床变量与SHAP值(结局之间的关联,变化趋势),示例数据没有提供连续变量,因此次图呈现的都是分类变量,存在连续变量时,点会呈现散状分布,黄色线条为拟合的变化趋势

后续跟新,各个生存模型的网页制作(网页制作目前还在美化,增加内容),可实现RSF、Cox、GBM、Coxboost、Survivalsvm、Xgboost 、Superpc、plsRcox所有模型的网页制作。

整套课程代码,包含了SCI的机器学习的正常分析流程,并包含了使用的示例数据,数据准备的指导、相关代码的解释。

整套课程代码一经售出,全程售后服务,包含代码报错解决,如果需要可以进行简单代码讲解,直到出现结果为止。

整套课程创建以及版权归小庞统计所有!

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