在安装tophat2安装简单但会碰到小问题,

  1. tophat2安装
    wget http://ccb.jhu.edu/software/tophat/downloads/tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz
  2. 解压
    tar -zxvf tophat-2.1.0.Linux_x86_64.tar.gz
  3. 加入PATH
    export PATH=/home/ZQK/tophat-2.1.0.Linux_x86_64/:$PATH
  4. 测试
    tophat2
    在这里插入图片描述测试出现问题

出现这一问题原因是topcoat更新语法不适用于当前python版本,要做的事吧tophat注释修改一下。
找到你的python2 :whereis python2
选取python2的路径

进入文件夹tophat-2.1.0.Linux_x86_64/ ,vim tophat ,把路径更改,保存即可。

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