比如，一个典型的git am失败，可能是这样的：

$ git am PATCH

Applying: PACTH DESCRIPTION

error: patch failed: file.c:137

error: file.c: patch does not apply

error: patch failed: Makefile:24

error: libavfilter/Makefile: patch does not apply

Patch failed at 0001 PATCH DESCRIPTION

When you have resolved this problem run "git am --resolved".

If you would prefer to skip this patch, instead run "git am --skip".

To restore the original branch and stop patching run "git am --abort".

正如你所见，如果冲突发生，git只是输出上述信息，然后就停下来。一个小冲突会导致整个patch都不会被集成。

处理这种问题的最简单方法是先使用 git am --abort，然后手动的添加此patch, patch -p1 < PATCH，手动解决掉代码冲突，最后使用 git commit -a 提交代码。但是这样做有个问题就是你会失去PATCH中原本包含的commit信息（比如From，Date，Subject，Signed-off-by等）。应该有一种更聪明的方法。

在 .git/rebase-apply 目录下，存放着相应的补丁文件，名字是“0001” （在更新的git版本中，存放补丁文件的目录名有所改变，这里使用的git版本是 1.7.4.1）。

事实上，你可以使用 git apply 命令打patch（git apply 是git中的patch命令）。如同使用 patch -p1 命令时一样，然后手动解决代码冲突（检视生成的 .rej 文件，与冲突文件比较，修改冲突内容，并最终把文件加入到index中）：

$ git apply PATCH --reject

$ edit edit edit

（译注：根据.rej文件手动解决所有冲突）

$ git add FIXED_FILES

$ git am --resolved

就这么简单！

想多一些解释，好吧。git am 并不改变index，你需要使用 git apply --reject 打patch（保存在 .git/rebase-apply），手动解决代码冲突，（译注：使用 git status 列出所有涉及文件），把所有文件（不仅仅是引起冲突的文件）添加到（git add）index，最后告诉 git am 你已经解决（--resolved）了问题。这样做的好处是你不需要重新编辑commit信息。而且，如果你正在打的是一系列patch（就是说你在打的是多个patch，比如 git am *.patch）你不需要使用 git am --abort，然后又 git am。

新手刚刚开始接触 Git，为了维护核心仓库的“纯洁”，避免太多无关信息被误提交进仓库（再次批评一些图形化工具默认的“Select All”），采用了核心仓库只读，邮件提交 patch，审核后再提交的工作流程。

期间有时会遇到合并冲突，正常的原因一般是未及时下载新版本产生了冲突，特殊一点的原因是手工修改 patch 内容导致的。有时候看注释写得不够准确，忍不住就改了，有时候是 Geany 保存时自动去除了 patch 原文中的行尾空格，有时候是文件回车格式、BOM 等变动了，总之合并 patch 的时候，如果生成 patch 的“原稿”找不到，一般就产生了冲突，比如：

$ git am 0001-BUG-Sybase.patch
Applying: CHG: 读取Sybase如果时间为空,设置默认时间的修改
error: patch failed: source.php:38
error: source.php: patch does not apply
Patch failed at 0001.
When you have resolved this problem run "git am --resolved".
If you would prefer to skip this patch, instead run "git am --skip".
To restore the original branch and stop patching run "git am --abort".


刚开始一看有些懵，因为没有任何冲突在哪里的提示，后来找到一种方法，am 操作出问题后先手工 apply：

$ git apply --reject 0001-BUG-Sybase.patch
Checking patch source.php...
error: while searching for:
// 注释
// 以下为几行代码片断
error: patch failed: source.php:38
Applying patch source.php with 1 rejects...
Rejected hunk #1.


这样，就把没有冲突的文件先合并了，剩下有冲突的作了标记。先看输出，error: while searching for: 说明是这段代码有冲突，error: patch failed: source.php:38 指明了产生冲突的代码片断的开始行号，相应的，patch 中应该有这么一段：

diff --git a/source.php b/source.php
index 8770441..4e77b8a 100644
--- a/source.php
+++ b/source.php
@@ -38,27 +38,23 @@ class Site extends Module
// 注释
// 以下为几行代码片断


同时，还会产生一个 source.php.rej 文件，里面也是上面这段因为冲突无法合并的代码片断。

现在，在这段代码中查找冲突原因，并对文件进行修改，source.php.rej 参考完了可以删掉。改好之后，用 git add 把 source.php 添加到缓冲区，同时也要把其他没有冲突合并成功了的文件也加进来，因为在作 apply 操作的时候他们也发生了变化：

$ git add source.php
$ git add 其他 apply 进来的文件们


最后：

$ git am --resolved
Applying: CHG: 读取Sybase如果时间为空,设置默认时间的修改


大功告成。

中间如果处理乱了，用 git reset 恢复即可，所以合并 patch 在一个“干净”的分支上处理更好。