1. 公开目录 
2. WEB-INF/web.xml 文件，发布描述符（必选） 
3. WEB-INF/classes 目录，编译后的Java 类文件（可选） 
4. WEB-INF/lib 目录，Java 类库文件（*.jar）（可选） 

公开目录存放所有可以被用户的访问的资源, 包括 .html, .jsp, .gif, .jpg, .css, .js, .swf等等。 
WEB-INF 目录是一个专用区域, 容器不能把此目录中的内容提供给用户。这个目录下的文件只供容器使用, 里面包含不应该由客户直接下载的资源, 例如: Servlet(这些组件包括应用程序逻辑以及对其他资源如数据库的可能访问), Web 应用程序中servlet 可直接访问的其他任何文件, 在服务器方运行或者使用的资源(如Java 类文件和供servlet 使用的JAR 文件), 由您的应用程序生成的临时文件, 发布描述符以及其它任何配置文件。这些资源是专用的, 因此只能由它们自己的Web 应用程序及容器访问。特别地, JSP/Servlet 程序文件也能通过ServletContext 访问到这个目录下的文件, 例如JSP 中可以通过application.getRealPath(“/WEB-INF/web.xml”) 访问到发布描述符文件的路径。 Web 容器要求在你的应用程序中必须有WEB-INF 目录。注意： 如果你的Web 应用程序中没有包含这个目录, 它可能将无法工作（这是因为不同的服务器对此情况的处理不甚一致，所以有时候也能工作）。 
WEB-INF 中包含着发布描述符, 一个classes 目录和一个lib 目录, 以及其它内容。发布描述符(deployment descriptors)是J2EE Web 应用程序不可分割的一部分(也就是说是它的最小部分, 必不可缺的一部分)。它们在应用程序发布之后帮助管理 Web 应用程序的配置。对于 Web 容器而言, 发布描述符是一个名为web.xml 的XML 文件, 存储在Web 应用程序的 /WEB-INF 目录下。

发布描述符有多种用途: 
• 为 Servlet 和Web 应用程序提供初始化参数 这使我们的Web 应用程序中的硬性编写的代码的初始化值更少。例如常见的<param-name>, <param-value>标记, 就可以为Servlet 提供参数, 这个参数可以在init() 方法中加载。 Struts 的ActionServlet也是通过这种方式来找到它们需要的配置文件struts-config.xml 的位置, 从而加载并分析它,来初始化Struts 框架用到的各种FromBean, Action, Forward 等。 
• Servlet/JSP 定义可以为 Web 应用程序中的每个Servlet 或者预编译的JSP 网页提供定义。包括 Servlet/JSP 的名字, Servlet/JSP 的类以及一个可选的描述。 
• Servlet/JSP 映射 Web 容器使用这些信息把进入请求映射到servlet 和JSP 网页。 
• MIME 类型由于每个 Web 应用程序可以包含多种内容类型, 因此我们可以在发布描述符中为每一种类型指定MIME 类型。
• 安全性 我们可以使用发布描述符来管理应用程序的访问控制。例如, 可以指定我们的Web 应用程序是否需要登录, 如果需要的话, 应该使用什么登录页面, 以及用户会作为何种角色。发布描述符还可以用来自定义其他元素, 包括欢迎网页, 出错网页, 会话配置。classes 目录用于存储编译过的servlet 及其它程序类, 例如JavaBean。如果一个程序有打包的JAR 文件(例如一个第三方API 打包成了一个JAR 文件, 如Struts 框架的类库 
struts.jar, MySQL 的数据库JDBC 驱动程序文件mysql-connector-java-3.1.11-bin.jar 等),那么它们可以被复制到lib 目录中(如果解压缩这些压缩包的话, 请将它们复制到classes 目录中)。 Web 容器使用这两个目录来查找servlet 及其他相关类,也就是说, 容器的类装入器会自动查看classes 目录, 以及lib 目录下的JAR 文件。这就意味着你不需要明确的把这些类和JAR 文件添加到CLASSPATH 中。 Web 容器自动将这两个目录中的文件加入Web应用的类路径中。

文章来自于：http://blog.csdn.net/bluesnail216/article/details/7744607

参考文章：http://blog.csdn.net/ystyaoshengting/article/details/6204886