freesurfer并行处理体会

就在今天，终于搞定了freesurfer并行处理parallel。
我是在VMware workstation16版本安装的Ubuntu20.04，

我参考了很多资料，并且也得到了很多人的帮助，在此我把别人的给予送给大家，希望大家能从中获得些帮助。
第一步：打开终端（边栏终端即可）输入命令rm Homebrew.sh ; wget https://gitee.com/cunkai/HomebrewCN/raw/master/Homebrew.sh ; bash Homebrew.sh
依此完成操作即可。完成后重启Ubuntu20.04。

第二步：重启Ubuntu20.04后
打开终端（桌面或边栏终端即可）输入brew install parallel
（到最后会有出错）

第三步：随便打开终端，输入以下命令安装parallel。
sudo apt install parallel # version 20161222-1.1（是否可以跳过第二步，直接第三步大家可以试试）

第四步：在Music中（其他地方打开也可以，nii格式文件我放在了Music中），打开终端，输入以下命令
export SUBJECTS_DIR=pwd
然后在输入下面命令即可开始运行。（jobs 8代表我的Ubuntu20.04是8核的，如果你的是6核或4核的就相应的把8更改为6或4）
ls *.nii | parallel --jobs 8 recon-all -s {.} -i {} -all -qcache