摘要:生物多样性的价值越来越被人们所认识与利用。生物多样性的原因是生物进化的过程中，物种和物种之间、物种和无机环境之间共同进化形成结果。对生物进行系统发育分析可以发现它们之间的亲缘关系及进化过程，从而对其的利用更有针对性。本文综述了系统进化的各种研究方法以及生物信息学在其中的应用,并对生物信息学中所采用的研究生物进化关系的方法进行了比较，以及分析了生物信息学的发展趋势。关键词：系统发育分析; 生物

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