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原文实际完成大规模儿童胰腺队列、常规组织学、共聚焦与全切片成像、17位供体31-plex CODEX、空间分析和部分供体胰岛动态灌流;PCF(CODEX)空间蛋白组与较大规模组织学数据共同显示,新生期36.13%的内分泌细胞位于直径小于50微米的细胞簇,婴儿期和儿童期分别为25.67%与24.15%。新生期内分泌细胞中β、δ和α细胞比例约为42.38%、34.04%和23.58%;研究以出生至10

原文实际完成大规模儿童胰腺队列、常规组织学、共聚焦与全切片成像、17位供体31-plex CODEX、空间分析和部分供体胰岛动态灌流;PCF(CODEX)空间蛋白组与较大规模组织学数据共同显示,新生期36.13%的内分泌细胞位于直径小于50微米的细胞簇,婴儿期和儿童期分别为25.67%与24.15%。新生期内分泌细胞中β、δ和α细胞比例约为42.38%、34.04%和23.58%;研究以出生至10

Visium空间转录组在该研究中发挥了重要的区域定位作用,帮助研究者识别了上皮形态发生过程中不同基因模块的空间分布规律,以及间质细胞围绕上皮形成的同心层结构。这种从转录层到蛋白层的递进观察,为理解发育中的细胞互作提供了更完整的空间多组学线索,可作为后续组织工程和发育生物学研究的实验设计参考。对于复杂三维组织的发育研究而言,PCF与空间转录组的联合有助于将基因表达地图转化为更具体的蛋白功能观察,为机

NSCLC空间单细胞蛋白组研究揭示,EGFR/KRAS突变各自"雕刻"出不同的免疫空间生态位

近期,《Nature Immunology》发表的一篇题为“Distinct spatial organization governs oral mucosal immunity”的研究中,运用多种前沿空间组学和单细胞技术,深入解析人类牙龈(口腔黏膜)在健康和牙周炎状态下免疫细胞的空间分布、组织方式及其与上皮、基质细胞的相互作用,从而阐释了这个“具有愈合特权”的黏膜屏障维持稳态和应对疾病的独特机制

研究利用IN-DEPTH流程重点开展了PCF(CODEX)联合空间转录组的分析。首先研究对PCF(CODEX)的多轮循环检测进行了评估,在脑组织切片中利用PCF(CODEX)对PLVAP蛋白进行了60轮的循环检测,结果显示了PLVAP蛋白的表达信号在所有轮次循环中保持非常好的一致性,说明了PCF(CODEX)技术的稳定和可靠性。为了对比IN-DEPTH先空间蛋白组后空间转录组的效果,研究对比了先P

例如,EVT中的转录因子(如FOS)在激活HLA-G等EVT基因的同时,会抑制CGA等SCT基因。这项研究通过前沿的多组学与空间技术,揭示了人类母胎界面在妊娠期间的复杂细胞生态系统、动态发育程序、细胞间互作网络及其调控机制,并将这些发现与重大妊娠并发症的遗传基础联系起来,为生殖医学和发育生物学研究提供了极为宝贵的资源和新的研究方向。这项发表于《自然》的研究在空间技术整合方面,为旨在发表顶级期刊的工

首次基于活体健康供体的肝脏样本,运用空间多组学技术,重新定义了人类的肝脏分区模式

PCF(CODEX)生成的单细胞超高重蛋白表达矩阵,与空间转录组数据在同一个细胞或区域尺度上对齐,可以进行真正的跨模态联合分析,与转录组提供的全基因组表达信息相结合,能够更可靠地推断细胞功能、信号通路活性和细胞间通讯,从而更准确地揭示驱动癌前到癌症转变的分子机制。简单来说,加入PCF(CODEX)技术,是为了让研究既能看到基因的“指令”(转录组),也能看到细胞实际执行的“动作”(蛋白组),从而绘制

借助这些技术,研究者得以精准定位不同 CAF 亚型的原位空间分布,解析其与肿瘤细胞、免疫细胞的原位互作关系,发现与患者预后、治疗敏感性直接相关的空间结构特征,彻底革新了我们对肿瘤基质微环境的认知。其次,CAFs 的高度可塑性,使得单一靶点的抑制极易出现代偿性的表型转换,导致治疗失效;跨癌种的空间多组学研究证实,CAFs 的亚型分布具有高度的空间特异性,在实体瘤中普遍存在四大保守的肿瘤生态位,每个生








