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python使用清华源镜像安装包

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple packages

#python
理解高通量测序技术和单细胞测序技术(自用)

首先明确单细胞测序技术不一定是高通量的,有单细胞测序技术,高通量测序技术,包括高通量测序技术在内的所有高通量技术,用于单细胞测序的高通量技术。如果我们要从技术层面理解单细胞测序并分析其优势,就必然绕不开对“单细胞测序”“高通量技术”等概念的准确的把握。我们必须搞清楚,当一种技术前面带了“单细胞”(Single-cell)或“高通量”(High-throughput)的字眼时,它们分别代表了什么。单

single cell marker 基因数据库

Mouse Cell Atlas:https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fbis.zju.edu.cn%2FMCA%2FCellMarker:https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fbio-bigdata.hrbmu.edu.cn%2FCellMarker%2FBD||cd_marker_handb

Eclipse中Tomcat“子容器启动失败”解决方法

今天因为在eclipse中添加了maven,东搞西搞,导致Servers疯狂报错:网上看了很多教程,但是都没有用,我开启tomcat的startup.bat,发现web项目可以成功在浏览器上部署,但是eclipse里面的就依然是子容器启动失败等不知道什么鬼的错误,这证明Tomcat没毛病,有毛病的是我Eclipse里面的Servers,果断右键delete。最后重新把项目run asRun on

#tomcat#eclipse
FindVariableFeatures(高可变基因)和FindMarkers(差异表达基因)的区别

FindVariableFeatures()–特征选择:高变异基因就是highly variable features(HVGs),就是在细胞与细胞间进行比较,选择表达量差别最大的基因,Seurat使用FindVariableFeatures函数鉴定高可变基因,这些基因在PBMC不同细胞之间的表达量差异很大(在一些细胞中高表达,在另一些细胞中低表达)。默认情况下,会返回2,000个高可变基因用于下

生物信息学三大数据库NCBI-ENSEMBL-UCSC

NCBINCBI (National Center for Biotechnology Information,美国国立生物技术信息中心)于1988年11月4日建立,是NIH(美国国立卫生研究院)的NLM(国立医学图书馆)的一个分支。目的是通过提供在线生物学数据和生物信息学分析工具来帮助人类更好的认知生物学问题。 目前有将近40个在线的文库和分子生物学数据库,包括:PubMed, PubMed C

RuntimeError: Attempting to deserialize object on a CUDA device but torch.cuda.is_available() is F..

真是乌鱼子,因为是在另一个服务器上写的代码,就忘了加gpu参数了,以后不可以犯这种错误了。

#深度学习#机器学习#python
RuntimeError: Attempting to deserialize object on a CUDA device but torch.cuda.is_available() is F..

真是乌鱼子,因为是在另一个服务器上写的代码,就忘了加gpu参数了,以后不可以犯这种错误了。

#深度学习#机器学习#python
生物信息学三大数据库NCBI-ENSEMBL-UCSC

NCBINCBI (National Center for Biotechnology Information,美国国立生物技术信息中心)于1988年11月4日建立,是NIH(美国国立卫生研究院)的NLM(国立医学图书馆)的一个分支。目的是通过提供在线生物学数据和生物信息学分析工具来帮助人类更好的认知生物学问题。 目前有将近40个在线的文库和分子生物学数据库,包括:PubMed, PubMed C

到底了