NCBINCBI (National Center for Biotechnology Information，美国国立生物技术信息中心）于1988年11月4日建立，是NIH（美国国立卫生研究院）的NLM（国立医学图书馆）的一个分支。目的是通过提供在线生物学数据和生物信息学分析工具来帮助人类更好的认知生物学问题。 目前有将近40个在线的文库和分子生物学数据库，包括：PubMed, PubMed C

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先看一下数学中的卷积：卷积就像加减乘除一样是一种运算，只是低等数学用不到，就没教，它是指：把二元函数 U(x,y) = f(x)g(y) 卷成一元函数 V(t) ，俗称降维打击。在bulk RNA的中，就是把平均值看作单个细胞表达值与某个函数（和检测方法有关）的卷积。获得样本bulk RNA 表达量的过程，就是一个卷积的过程，而反卷积，是卷积运算的逆运算。https://cloud.tencent

区分Bulk测序和高通量单细胞测序中的提高细胞通量首先区分下单细胞测序和Bulk测序：单细胞测序(scRNA-seq)与bulk测序（Bulk RNA-seq）的不同之处是BulkRNA-seq是提取组织、器官或一群细胞的混合RNA（bulkRNA）进行测序，能够得到的是一群细胞的转录组的平均数据，或者说是代表性数据，细胞群体中单个细胞的特异性信息往往被掩盖，比如特异表达的基因或RNA不同的剪接体

假阴性错误（false-negative errors）: 高水平的基因可能偶尔没有检测到假阳性错误（false-positive errors）: 低水平表达的基因由于扩增偏差，可能显得过于丰富，导致假阳性错误 一、P值和q值的定义P值（P-value）即概率，反应某一事件发生的可能性大小。统计学根据显著性检验方法得到的P值，通常以P＜0.05为显著，P＜0.01为极显著，其含义为：抽样误差导致

kb=千碱基 kilobasent＝核苷酸 nucleotidebp＝碱基对 base pair

首先明确单细胞测序技术不一定是高通量的，有单细胞测序技术，高通量测序技术，包括高通量测序技术在内的所有高通量技术，用于单细胞测序的高通量技术。如果我们要从技术层面理解单细胞测序并分析其优势，就必然绕不开对“单细胞测序”“高通量技术”等概念的准确的把握。我们必须搞清楚，当一种技术前面带了“单细胞”（Single-cell）或“高通量”（High-throughput）的字眼时，它们分别代表了什么。单

今天因为在eclipse中添加了maven,东搞西搞，导致Servers疯狂报错：网上看了很多教程，但是都没有用，我开启tomcat的startup.bat，发现web项目可以成功在浏览器上部署，但是eclipse里面的就依然是子容器启动失败等不知道什么鬼的错误，这证明Tomcat没毛病，有毛病的是我Eclipse里面的Servers,果断右键delete。最后重新把项目run asRun on

FindVariableFeatures()–特征选择:高变异基因就是highly variable features（HVGs），就是在细胞与细胞间进行比较，选择表达量差别最大的基因，Seurat使用FindVariableFeatures函数鉴定高可变基因，这些基因在PBMC不同细胞之间的表达量差异很大（在一些细胞中高表达，在另一些细胞中低表达）。默认情况下，会返回2,000个高可变基因用于下

NCBINCBI (National Center for Biotechnology Information，美国国立生物技术信息中心）于1988年11月4日建立，是NIH（美国国立卫生研究院）的NLM（国立医学图书馆）的一个分支。目的是通过提供在线生物学数据和生物信息学分析工具来帮助人类更好的认知生物学问题。 目前有将近40个在线的文库和分子生物学数据库，包括：PubMed, PubMed C