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miRTarBase:实验验证的miRNA靶基因数据库简介miRTarBase是一个手工收集的,经过实验验证过的miRNA靶基因数据库(MTI, MicroRNA-Target Interactions),网址如下http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php自miRTarBase数据库于2011年首次亮相以来,miRNA与靶基因相关信...
TargetScan:哺乳动物miRNA靶基因数据库哺乳动物中的miRNA通过结合转录本序列的3’UTR区,从而发挥转录后调控作用。TargetScan是一个专门分析哺乳动物miRNA靶基因的软件,并且根据已有的分析结果整理成了数据库,网址如下http://www.targetscan.org/vert_72/根据不同的代表物种,分成以下几个子数据库TargetScanHuman...
miRWalk:综合型的miRNA靶基因数据库miRWalk是一个综合性的miRNA靶基因数据库,收录了人,小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息,和mirDIP类似,也是一个整合型数据库,整合了来自miRDB, TargetScan, miRTarBase等数据库中的信息,网址如下http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/该数据库中共包含以下5个物种的mi...
TargetScan:哺乳动物miRNA靶基因数据库哺乳动物中的miRNA通过结合转录本序列的3’UTR区,从而发挥转录后调控作用。TargetScan是一个专门分析哺乳动物miRNA靶基因的软件,并且根据已有的分析结果整理成了数据库,网址如下http://www.targetscan.org/vert_72/根据不同的代表物种,分成以下几个子数据库TargetScanHuman...
RNAcentral:非编码RNA数据库RNAcentral是由EBI开发的一个非编码RNA数据库,整合了Ensembl,GENCODE,LNCipedia, miRbase, Rfam等多个数据库中的非编码RNA信息,旨在为ncRNA的研究提供一个统一的参照,网址如下https://rnacentral.org/目前最新版本为v10, 整合了来自miRBase v22和LNCipedi...
相信每位刚接触神经网络的时候都会先碰到BP算法的问题,如何形象快速地理解BP神经网络就是我们学习的高级乐趣了(画外音:乐趣?你在跟我谈乐趣?)本篇博文就是要简单粗暴地帮助各位童鞋快速入门采取BP算法的神经网络。BP神经网络是怎样的一种定义?看这句话:一种按“误差逆传播算法训练”的多层前馈网络。 ...
RNAcentral:非编码RNA数据库RNAcentral是由EBI开发的一个非编码RNA数据库,整合了Ensembl,GENCODE,LNCipedia, miRbase, Rfam等多个数据库中的非编码RNA信息,旨在为ncRNA的研究提供一个统一的参照,网址如下https://rnacentral.org/目前最新版本为v10, 整合了来自miRBase v22和LNCipedi...
TargetScan:哺乳动物miRNA靶基因数据库哺乳动物中的miRNA通过结合转录本序列的3’UTR区,从而发挥转录后调控作用。TargetScan是一个专门分析哺乳动物miRNA靶基因的软件,并且根据已有的分析结果整理成了数据库,网址如下http://www.targetscan.org/vert_72/根据不同的代表物种,分成以下几个子数据库TargetScanHuman...
miRDB:软件预测的哺乳动物miRNA靶基因数据库miRDB通过MirTarget这个软件预测了人,小鼠等多个物种的miRNA靶基因信息,并将其整理成了数据库,网址如下http://www.mirdb.org/该数据库中涵盖的物种如下huamanmouseratdogchicken每个物种相关的miRNA和靶基因数量统计如下除了提供软件预测的靶基...
Rfam——非编码RNA家族数据库Rfam是一个RNA分类信息的数据库,根据多序列比对结果,二级结构的一致性,协方差模型对各种RNA及顺式作用元件进行了分类整理,网址如下http://rfam.xfam.org/最新版本为14.1, 在Rfam数据库中,包括以下3大功能类型的分子ncRNA genescis-regulatory elementsself-splici...







