使用Aspera上传数据到SRA
Install下载地址(网上有好多下载地址是错误的):https://downloads.asperasoft.com/en/downloads/8?listtar -zxvf ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.tar./ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64找到安装路径,将bin文件
·
Install
下载地址(网上有好多下载地址是错误的):
https://downloads.asperasoft.com/en/downloads/8?list
tar -zxvf ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64.tar
./ibm-aspera-connect-3.9.9.177872-linux-g2.12-64
找到安装路径,将bin文件夹添加到$PATH
upload fastq.gz to SRA
ascp -i <path/to/key_file> -QT -l100m -k1 -d <path/to/folder/containing files> subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/734256624_qq.com_GdACIz50
<path/to/key_file>是在SRA提交页面下载的一个aspera.openssh文件,需要引用绝对路径
<path/to/folder/containing files>是包含所有fastq.gz文件的文件夹,需要引用绝对路径
更多推荐
已为社区贡献1条内容
所有评论(0)